38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1030 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1030  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 486 aa  956    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0990099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2001  TPR repeat-containing protein  45.88 
 
 		 500 aa  360  3e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0783856  normal  0.0172593 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1681  hypothetical protein  29.15 
 
 		 371 aa  82  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2165  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0208318  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5445  hypothetical protein  26.12 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262765  normal  0.835503 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0827  hypothetical protein  26.09 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.748424 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1011  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 800 aa  53.5  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.926102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 		 4079 aa  53.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0684  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 626 aa  50.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.073347 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 		 265 aa  50.8  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  21.31 
 
 		 614 aa  50.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1683  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 		 942 aa  49.3  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.354598 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4642  TPR repeat-containing protein  25.18 
 
 		 249 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  28.87 
 
 		 729 aa  49.3  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  22.68 
 
 		 725 aa  48.5  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1385  TPR domain-containing protein  27.61 
 
 		 400 aa  48.5  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00692083 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.7 
 
 		 2240 aa  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.97 
 
 		 557 aa  48.1  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  34.12 
 
 		 562 aa  47  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  24.91 
 
 		 1676 aa  47  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.27 
 
 		 639 aa  47  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.5 
 
 		 927 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 		 884 aa  46.6  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2838  tetratricopeptide TPR_2  28.78 
 
 		 940 aa  46.2  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 1069 aa  45.8  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  24.49 
 
 		 1737 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.93 
 
 		 293 aa  45.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26 
 
 		 645 aa  45.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000607684  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40924  predicted protein  29.79 
 
 		 375 aa  44.7  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.458934  normal  0.213634 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5044  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.75 
 
 		 233 aa  44.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9475  predicted protein  21.71 
 
 		 336 aa  44.3  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  22.67 
 
 		 750 aa  43.9  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  24.8 
 
 		 576 aa  43.9  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0732  TPR repeat-containing protein  30.38 
 
 		 235 aa  43.9  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.04 
 
 		 784 aa  43.5  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3025  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 		 185 aa  43.5  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.8 
 
 		 818 aa  43.5  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  21.4 
 
 		 329 aa  43.1  0.01  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>