33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2001 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2001  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 500 aa  1006    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0783856  normal  0.0172593 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1030  TPR repeat-containing protein  46.3 
 
 		 486 aa  391  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0990099 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1681  hypothetical protein  30.25 
 
 		 371 aa  84.3  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0827  hypothetical protein  23.55 
 
 		 394 aa  60.5  0.00000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.748424 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 927 aa  56.6  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 		 329 aa  55.8  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2165  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 		 382 aa  53.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0208318  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2297  TPR domain-containing protein  28.57 
 
 		 226 aa  48.9  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0990  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.18 
 
 		 410 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113297  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  27.17 
 
 		 729 aa  48.9  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  23.47 
 
 		 565 aa  48.5  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  20.2 
 
 		 567 aa  47  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  24.34 
 
 		 265 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  25.08 
 
 		 804 aa  46.2  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2936  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 		 200 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.196962 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 		 4079 aa  46.2  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 		 1421 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 827 aa  45.8  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 878 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2615  TPR domain-containing protein  27.47 
 
 		 196 aa  45.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  24.61 
 
 		 465 aa  45.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 301 aa  45.1  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  21.5 
 
 		 1827 aa  44.7  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6906  cytochrome C family protein  26.58 
 
 		 758 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  20.56 
 
 		 1297 aa  44.3  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  24.26 
 
 		 1276 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 279 aa  43.9  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 750 aa  43.9  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.63 
 
 		 810 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  23.94 
 
 		 465 aa  43.5  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0684  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 		 626 aa  43.5  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.073347 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 		 883 aa  43.9  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0430  TPR domain-containing protein  21.76 
 
 		 338 aa  43.5  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0605051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>