12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0827 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_0827  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  805    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.748424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1030  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 486 aa  60.5  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0990099 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1681  hypothetical protein  23.47 
 
 		 371 aa  59.3  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070377  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1385  TPR domain-containing protein  21.13 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00692083 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2001  TPR repeat-containing protein  23.56 
 
 		 500 aa  57  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0783856  normal  0.0172593 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2165  TPR repeat-containing protein  21.72 
 
 		 382 aa  50.1  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0208318  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5445  hypothetical protein  21.41 
 
 		 415 aa  50.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262765  normal  0.835503 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  24.43 
 
 		 409 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 		 323 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2701  FecR protein  26.39 
 
 		 1237 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0375839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  23.23 
 
 		 265 aa  43.5  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.07 
 
 		 557 aa  43.1  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>