217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2838 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2838  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 940 aa  1896    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01444  TPR repeat protein  32.2 
 
 		 937 aa  452  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0688079  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1338  tetratricopeptide TPR_2  29.68 
 
 		 931 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  22.65 
 
 		 929 aa  142  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  23.41 
 
 		 931 aa  131  6e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  23.3 
 
 		 934 aa  126  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0196  TPR repeat-containing protein  24.34 
 
 		 927 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0781  TPR domain-containing protein  22.54 
 
 		 924 aa  113  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.55707  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1620  TPR repeat-containing protein  22.47 
 
 		 900 aa  111  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  21.65 
 
 		 935 aa  109  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  24.16 
 
 		 767 aa  108  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1943  TPR repeat-containing protein  22.81 
 
 		 952 aa  103  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  21.66 
 
 		 884 aa  95.1  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  23.21 
 
 		 729 aa  94.4  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0156  TPR repeat-containing protein  21.68 
 
 		 955 aa  90.9  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2439  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 		 923 aa  85.9  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.65 
 
 		 599 aa  78.6  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  23.77 
 
 		 808 aa  75.9  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  24.29 
 
 		 1676 aa  75.5  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  22.56 
 
 		 884 aa  75.1  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3073  TPR repeat-containing protein  22.46 
 
 		 886 aa  71.2  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  20.91 
 
 		 860 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  21.2 
 
 		 4079 aa  68.9  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  21.5 
 
 		 1067 aa  68.6  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2393  TPR repeat-containing protein  21.01 
 
 		 944 aa  68.2  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  21.41 
 
 		 883 aa  66.6  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  23.95 
 
 		 1138 aa  65.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  21.25 
 
 		 729 aa  65.5  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.01 
 
 		 557 aa  65.1  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  23.76 
 
 		 573 aa  64.7  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  21 
 
 		 1069 aa  64.7  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 		 697 aa  64.7  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3097  hypothetical protein  23.4 
 
 		 933 aa  63.9  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.681672  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  22.59 
 
 		 638 aa  63.2  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0178  hypothetical protein  24.71 
 
 		 880 aa  63.5  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0441956  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  22.37 
 
 		 992 aa  62.8  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1628  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  21.58 
 
 		 924 aa  61.6  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57702  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.57 
 
 		 2240 aa  61.6  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 927 aa  61.6  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  22.06 
 
 		 883 aa  61.6  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  21.9 
 
 		 864 aa  59.7  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0310  TPR domain-containing protein  19.92 
 
 		 892 aa  59.3  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  25.97 
 
 		 577 aa  59.3  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.76 
 
 		 572 aa  59.3  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  22.05 
 
 		 882 aa  58.9  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  22.31 
 
 		 882 aa  58.5  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1334  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.72 
 
 		 512 aa  58.5  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.278248  normal  0.0416734 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 		 879 aa  58.5  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.71 
 
 		 566 aa  58.5  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4396  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.98 
 
 		 602 aa  58.5  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 		 792 aa  58.2  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  21.51 
 
 		 562 aa  58.2  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1861  TPR repeat-containing protein  22.77 
 
 		 565 aa  57  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.244613  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  19.61 
 
 		 988 aa  57.4  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  25.43 
 
 		 577 aa  57  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0600  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 		 1112 aa  56.6  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.272318  normal  0.386774 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21 
 
 		 1056 aa  56.6  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  19.67 
 
 		 750 aa  56.2  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  24.59 
 
 		 1276 aa  56.2  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.99 
 
 		 572 aa  55.8  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0423  TPR repeat-containing protein  32.46 
 
 		 880 aa  55.8  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0262641 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  22.07 
 
 		 565 aa  55.5  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  20.71 
 
 		 2262 aa  55.5  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  18.6 
 
 		 366 aa  55.5  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  23.59 
 
 		 878 aa  55.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2579  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.7 
 
 		 786 aa  55.1  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  22.26 
 
 		 1694 aa  54.7  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  24.86 
 
 		 837 aa  54.7  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.32 
 
 		 689 aa  54.3  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3727  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 572 aa  53.9  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  22.75 
 
 		 810 aa  54.3  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  23.79 
 
 		 561 aa  54.3  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  23.79 
 
 		 561 aa  54.3  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1991  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.55 
 
 		 367 aa  54.3  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.0147414 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 		 1038 aa  54.3  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  22.71 
 
 		 313 aa  53.5  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  22.18 
 
 		 2262 aa  53.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  19.56 
 
 		 1056 aa  53.1  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03692  TPR domain protein  22.2 
 
 		 924 aa  53.1  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  22.4 
 
 		 221 aa  53.9  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0287  TPR repeat-containing protein  32.09 
 
 		 217 aa  53.5  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  20.67 
 
 		 1421 aa  53.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 750 aa  53.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 673 aa  53.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  23.5 
 
 		 789 aa  53.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0528  TPR domain-containing protein  21.35 
 
 		 917 aa  53.1  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1030  cellulose synthase operon protein C  21.43 
 
 		 1230 aa  53.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.32 
 
 		 624 aa  52.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  25.62 
 
 		 398 aa  53.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  18.67 
 
 		 1056 aa  52.4  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  23.31 
 
 		 827 aa  52.4  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  21.55 
 
 		 745 aa  52.4  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2796  TPR repeat-containing protein  20.81 
 
 		 621 aa  52  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.669916 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1030  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 		 486 aa  52  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0990099 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 567 aa  51.6  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  21.85 
 
 		 968 aa  51.6  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.04 
 
 		 571 aa  51.2  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  23.82 
 
 		 1979 aa  51.2  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  23.7 
 
 		 1252 aa  51.2  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  23.83 
 
 		 2401 aa  50.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>