More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11133 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_11133  TPR repeat protein  100 
 
 		 417 aa  828    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.474145  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2585  TPR repeat-containing protein  36.24 
 
 		 424 aa  243  3.9999999999999997e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.508719  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1934  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.47 
 
 		 413 aa  228  1e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2437  TPR repeat-containing protein  32.84 
 
 		 354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0563701  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  28.68 
 
 		 543 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  34.52 
 
 		 750 aa  75.1  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  29.13 
 
 		 1694 aa  72  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 927 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0990  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.72 
 
 		 410 aa  67.4  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113297  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 		 1276 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 		 827 aa  66.6  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  25.7 
 
 		 465 aa  65.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  24.86 
 
 		 937 aa  66.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 		 566 aa  65.5  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  34.68 
 
 		 878 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.5 
 
 		 810 aa  63.9  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  24.88 
 
 		 1676 aa  63.2  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  30.97 
 
 		 266 aa  62  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.96 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.02 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  22.6 
 
 		 837 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  34.04 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 685 aa  58.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 		 4079 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 		 750 aa  57.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 583 aa  57.4  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1598  hypothetical protein  35.96 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000392317  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1616  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 544 aa  57.8  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.797217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  28.71 
 
 		 745 aa  57  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  28.32 
 
 		 267 aa  57  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 448 aa  57  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18191  hypothetical protein  29.63 
 
 		 425 aa  56.6  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.888115 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 		 612 aa  56.2  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.87 
 
 		 2240 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  28.63 
 
 		 681 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 		 870 aa  55.8  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  24.83 
 
 		 725 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 		 265 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.64 
 
 		 293 aa  56.2  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  26.13 
 
 		 594 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  23.33 
 
 		 715 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  38.24 
 
 		 576 aa  55.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.78 
 
 		 632 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  22.41 
 
 		 955 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  24.46 
 
 		 568 aa  55.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 		 667 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  25.53 
 
 		 626 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  25.23 
 
 		 1138 aa  54.7  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 		 614 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  24.01 
 
 		 816 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 		 614 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  25.53 
 
 		 614 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  25.53 
 
 		 614 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2070  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.08 
 
 		 264 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0224916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  25.53 
 
 		 626 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 		 614 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 605 aa  53.9  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  35.34 
 
 		 352 aa  53.9  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1238  TPR repeat-containing protein  23.91 
 
 		 377 aa  53.9  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 		 605 aa  53.5  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1157  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 		 522 aa  53.5  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 		 376 aa  53.5  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1334  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.98 
 
 		 512 aa  53.5  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.278248  normal  0.0416734 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 		 486 aa  53.5  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 244 aa  53.1  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3772  TPR repeat-containing protein  22.05 
 
 		 208 aa  53.1  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  22.92 
 
 		 955 aa  53.1  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  31.25 
 
 		 936 aa  53.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_002950  PG1385  TPR domain-containing protein  24.43 
 
 		 400 aa  52.8  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00692083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0631  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 		 200 aa  52.4  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  25 
 
 		 577 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  24.11 
 
 		 398 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  29.2 
 
 		 795 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  22.91 
 
 		 1979 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0419  TPR repeat-containing protein  24.24 
 
 		 224 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.338331  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 		 934 aa  52.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1875  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 		 201 aa  52.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0551  TPR domain-containing protein  27.72 
 
 		 541 aa  53.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.475712  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.06 
 
 		 363 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1511  TPR domain-containing protein  22.91 
 
 		 525 aa  52  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000212111  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  26.37 
 
 		 1005 aa  52.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3102  TPR domain protein  23.94 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0131637  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2970  TPR repeat-containing protein  25.79 
 
 		 364 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47174  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  25.64 
 
 		 502 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2034  TPR repeat-containing protein  29.85 
 
 		 416 aa  51.6  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  24.48 
 
 		 729 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 265 aa  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11910  TPR repeat-containing protein  28.11 
 
 		 394 aa  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000944223  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  21.63 
 
 		 265 aa  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2362  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.68 
 
 		 256 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3107  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 		 219 aa  52.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.62 
 
 		 689 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 3145 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1463  response regulator receiver protein  30 
 
 		 454 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.292556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  28.71 
 
 		 1061 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  31.96 
 
 		 581 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0991  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 		 357 aa  52  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>