71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0070 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0070  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
201 aa  413  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000134059  normal  0.0131239 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3296  TPR repeat-containing protein  35.2 
 
 
193 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.173177  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2204  TPR repeat-containing protein  26.6 
 
 
191 aa  79.7  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0332088  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0031  Tetratricopeptide repeat protein  31.63 
 
 
192 aa  57.4  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1125  TPR domain-containing protein  31.9 
 
 
457 aa  54.3  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0757  TPR repeat-containing protein  32.73 
 
 
222 aa  52.8  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.572611  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 
605 aa  51.2  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  30.09 
 
 
632 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1385  TPR domain-containing protein  32.58 
 
 
400 aa  49.7  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00692083 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2431  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.54 
 
 
190 aa  48.9  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.232516  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0954  TPR domain-containing protein  33.93 
 
 
579 aa  48.5  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.178394 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 
597 aa  47.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1801  Tetratricopeptide repeat protein  26.67 
 
 
186 aa  47.4  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2575  TPR domain-containing protein  31.25 
 
 
451 aa  47.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000631564  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  32.22 
 
 
827 aa  46.2  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.26 
 
 
364 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1620  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 
900 aa  46.2  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0304  TPR repeat-containing protein  30.86 
 
 
324 aa  46.6  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000296078  hitchhiker  0.00226693 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 
643 aa  45.8  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1786  TPR repeat-containing protein  21.39 
 
 
190 aa  45.1  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0173384 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  21.68 
 
 
3560 aa  44.7  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1618  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 
586 aa  44.7  0.0009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.73577 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0711  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 
1113 aa  44.3  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.357595  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 
714 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2716  hypothetical protein  24.58 
 
 
905 aa  44.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  hitchhiker  0.00105391 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3141  tetratricopeptide TPR_2  27.21 
 
 
317 aa  44.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00286611  normal  0.0160397 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3946  TPR repeat-containing protein  37.04 
 
 
211 aa  44.7  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1601  hypothetical protein  33.67 
 
 
375 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  23.42 
 
 
1005 aa  43.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1772  hypothetical protein  33.67 
 
 
375 aa  43.9  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000657641  normal  0.0639898 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  27.56 
 
 
632 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0830  hypothetical protein  23.12 
 
 
251 aa  43.5  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000551764  normal  0.344384 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
2262 aa  43.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1496  hypothetical protein  33.67 
 
 
375 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0414  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.66 
 
 
587 aa  43.9  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 
1069 aa  43.9  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2192  TPR repeat-containing protein  26.04 
 
 
319 aa  43.9  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000199858  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  25.29 
 
 
686 aa  43.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 
718 aa  43.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0239  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 
326 aa  43.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.1 
 
 
572 aa  42.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4142  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
208 aa  42.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.31 
 
 
4079 aa  42.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  28.09 
 
 
2262 aa  43.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  24.58 
 
 
577 aa  43.1  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  24.58 
 
 
577 aa  43.1  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  25.85 
 
 
4489 aa  43.1  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0990  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 
410 aa  43.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113297  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 
356 aa  42.7  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1675  tetratricopeptide TPR_4  30.36 
 
 
542 aa  42.7  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 
423 aa  42.7  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3752  TPR repeat-containing protein  28 
 
 
473 aa  42.4  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  35.21 
 
 
879 aa  42.4  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.12 
 
 
1034 aa  42.4  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  36.54 
 
 
409 aa  42.4  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4917  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.87 
 
 
214 aa  42.4  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000226435  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2507  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
351 aa  42  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800453  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
618 aa  42  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.85 
 
 
2240 aa  42  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 
870 aa  42  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0599  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.91 
 
 
263 aa  41.6  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453663  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  24.78 
 
 
566 aa  41.6  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
762 aa  41.6  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 
589 aa  41.6  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3414  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.16 
 
 
274 aa  41.6  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.187348  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
1252 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
1252 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1812  TPR repeat-containing protein  32.47 
 
 
713 aa  41.6  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.154682 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1364  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.17 
 
 
264 aa  41.6  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000696413  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0195  TPR repeat-containing protein  29.85 
 
 
925 aa  41.2  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.39307  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2362  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.44 
 
 
256 aa  41.2  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>