17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3752 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3752  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 473 aa  951    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2170  tetratricopeptide TPR_2  40.05 
 
 		 446 aa  287  4e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0425666  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1742  hypothetical protein  39.37 
 
 		 451 aa  279  1e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.199498 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3156  hypothetical protein  36.7 
 
 		 442 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.469309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2532  tetratricopeptide TPR_2  38.26 
 
 		 442 aa  260  4e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101624  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2344  hypothetical protein  34.15 
 
 		 444 aa  239  8e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.95942  normal  0.269529 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2347  hypothetical protein  24.83 
 
 		 458 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.258493  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0928  calcium-binding EF-hand  34.46 
 
 		 431 aa  85.9  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0688898  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1557  hypothetical protein  27.83 
 
 		 429 aa  73.2  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  3.4261e-20  normal  0.109896 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1676  hypothetical protein  30.88 
 
 		 407 aa  54.3  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1898  TPR repeat-containing protein  21.11 
 
 		 458 aa  47.4  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.262238 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2204  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 		 191 aa  47  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0332088  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  25.39 
 
 		 3301 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1324  hypothetical protein  27.35 
 
 		 457 aa  46.6  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0130583 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0258  TPR repeat-containing protein  46 
 
 		 974 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1878  cytochrome c biogenesis factor-like  32.2 
 
 		 418 aa  44.7  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000213055  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3102  TPR domain protein  35.14 
 
 		 389 aa  44.3  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0131637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>