118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0304 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0304  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
324 aa  650    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000296078  hitchhiker  0.00226693 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  27.68 
 
 
1138 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0419  TPR repeat-containing protein  23.94 
 
 
224 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.338331  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  30.09 
 
 
366 aa  56.6  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
567 aa  56.2  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  26.55 
 
 
992 aa  54.7  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.51 
 
 
645 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000607684  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  25.73 
 
 
1676 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0616  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.05 
 
 
647 aa  53.9  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.1691e-34 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  25.57 
 
 
1039 aa  53.1  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 
542 aa  53.1  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  24.5 
 
 
436 aa  53.1  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
597 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  23.96 
 
 
436 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  27.69 
 
 
676 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2579  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.83 
 
 
786 aa  51.2  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.43 
 
 
363 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  27.21 
 
 
1061 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.43 
 
 
363 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.95 
 
 
810 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0058  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 
145 aa  50.1  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.393003  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
827 aa  50.1  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3213  TPR repeat-containing protein  24.31 
 
 
227 aa  50.1  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
3145 aa  49.7  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.71 
 
 
689 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  21.62 
 
 
576 aa  49.7  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2073  TPR domain-containing protein  22.51 
 
 
417 aa  48.9  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0409184  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  25.18 
 
 
681 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0258  TPR repeat-containing protein  23.86 
 
 
974 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  23.95 
 
 
729 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
565 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0116  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 
289 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3754  FkbM family methyltransferase  24.49 
 
 
569 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  25.19 
 
 
837 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  22.71 
 
 
329 aa  48.5  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 
374 aa  47.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1288  sulfotransferase  26.61 
 
 
636 aa  47.8  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494721  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  21.83 
 
 
468 aa  47.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  30.19 
 
 
267 aa  47  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  22.48 
 
 
1049 aa  47  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  23.58 
 
 
1297 aa  47  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  24.47 
 
 
1252 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  24.51 
 
 
265 aa  47  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  24.47 
 
 
1252 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  31.07 
 
 
706 aa  46.6  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1146  hypothetical protein  24.71 
 
 
299 aa  46.6  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0829  tetratricopeptide TPR_2  32.22 
 
 
394 aa  46.6  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0070  TPR repeat-containing protein  30.86 
 
 
201 aa  46.6  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000134059  normal  0.0131239 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5311  TPR repeat-containing protein  22.77 
 
 
652 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.616526  normal  0.118581 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.51 
 
 
265 aa  46.6  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.19 
 
 
878 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1722  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.39 
 
 
354 aa  46.2  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
3301 aa  46.2  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 
568 aa  46.2  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.8 
 
 
2240 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02410  general transcriptional repressor, putative  28.93 
 
 
1101 aa  45.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  22.88 
 
 
1067 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6471  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.87 
 
 
1274 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.707662  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1622  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 
254 aa  45.4  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  28.69 
 
 
936 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
395 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
632 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0008  TPR repeat-containing protein  21.95 
 
 
197 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.508518  hitchhiker  0.000270685 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  34.25 
 
 
409 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  20.16 
 
 
505 aa  45.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0701  TPR repeat-containing protein  22.73 
 
 
652 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 
435 aa  45.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1208  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 
389 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.675891  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  23.5 
 
 
1069 aa  44.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 
265 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  27.48 
 
 
402 aa  45.1  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.98 
 
 
4079 aa  44.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3220  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 
1178 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.166794 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0533  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 
418 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00172679  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.88 
 
 
639 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3932  cellulose synthase subunit BcsC  23.93 
 
 
1150 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.903843  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 
291 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5044  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.93 
 
 
233 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0856  sugar transporter superfamily protein  23.53 
 
 
198 aa  44.3  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  28.89 
 
 
607 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 
750 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 
607 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 
265 aa  44.3  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  24.81 
 
 
562 aa  44.3  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3811  cellulose synthase subunit BcsC  22.84 
 
 
1172 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.805678 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0195  TPR domain protein  24.65 
 
 
379 aa  44.3  0.003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.315867  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66638  glucose repression mediator protein  28.95 
 
 
815 aa  43.9  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 
607 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2822  tetratricopeptide repeat-containing protein  29.47 
 
 
290 aa  43.5  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0986349  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07986  hypothetical protein  24.07 
 
 
388 aa  43.5  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.249139  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3824  cellulose synthase subunit BcsC  22.84 
 
 
1150 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3992  cellulose synthase subunit BcsC  23.24 
 
 
1180 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.416047 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1288  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 
207 aa  43.1  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2560  tetratricopeptide TPR_2  24.44 
 
 
309 aa  43.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  22.8 
 
 
3172 aa  43.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  20.87 
 
 
321 aa  43.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 
687 aa  43.5  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0523  TPR repeat-containing protein  28.16 
 
 
631 aa  43.1  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0179552  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1796  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 
352 aa  43.1  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 
393 aa  43.1  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>