189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0523 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0523  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
631 aa  1253    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0179552  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  23.63 
 
 
750 aa  73.9  0.000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  28.12 
 
 
833 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.8 
 
 
572 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.84 
 
 
572 aa  71.6  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2282  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.38 
 
 
433 aa  70.1  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.883499  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  22.61 
 
 
864 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  21.95 
 
 
395 aa  69.7  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  23.97 
 
 
573 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  22.65 
 
 
573 aa  68.6  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  23.95 
 
 
1676 aa  68.2  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  22.91 
 
 
792 aa  65.5  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
597 aa  63.9  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  20.99 
 
 
1737 aa  63.5  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.68 
 
 
566 aa  63.5  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  22.25 
 
 
393 aa  63.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  22.66 
 
 
561 aa  62.4  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  23.65 
 
 
883 aa  62  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.17 
 
 
557 aa  60.8  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  22.88 
 
 
561 aa  60.5  0.00000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  21.82 
 
 
448 aa  59.7  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  21.75 
 
 
884 aa  59.3  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.76 
 
 
758 aa  59.7  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  24.83 
 
 
733 aa  58.9  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  23.58 
 
 
860 aa  58.9  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  21.55 
 
 
929 aa  58.5  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 
3145 aa  58.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  21.79 
 
 
887 aa  58.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  22.55 
 
 
423 aa  57.4  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.73 
 
 
639 aa  57.4  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  22.75 
 
 
927 aa  57.4  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  24.15 
 
 
1297 aa  57  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.07 
 
 
2240 aa  57  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  22.27 
 
 
782 aa  57  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.06 
 
 
466 aa  57  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2073  TPR domain-containing protein  26.33 
 
 
417 aa  55.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0409184  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  24.24 
 
 
1238 aa  55.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  24.76 
 
 
576 aa  55.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  23.34 
 
 
1040 aa  56.2  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  19.81 
 
 
1069 aa  56.2  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  23.23 
 
 
676 aa  55.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  20.92 
 
 
393 aa  55.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  22.03 
 
 
722 aa  55.1  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  19.94 
 
 
2262 aa  55.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  20.99 
 
 
1261 aa  53.9  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  22.58 
 
 
568 aa  53.9  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  23.21 
 
 
409 aa  53.9  0.000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  21.9 
 
 
573 aa  53.5  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  23.53 
 
 
436 aa  53.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1538  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 
1012 aa  53.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0101738  normal  0.837321 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  20.43 
 
 
1486 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.52 
 
 
818 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  19.54 
 
 
934 aa  52.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  22.83 
 
 
566 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  24.2 
 
 
622 aa  53.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02857  tetratricopeptide repeat protein  26.06 
 
 
391 aa  52.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3469  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 
1161 aa  53.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2439  TPR repeat-containing protein  23.22 
 
 
923 aa  52  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427579  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0433  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 
254 aa  52  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.017119  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  30.16 
 
 
405 aa  52  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  20.62 
 
 
700 aa  51.6  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  21.15 
 
 
486 aa  51.6  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  26.06 
 
 
837 aa  51.6  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  22.87 
 
 
402 aa  51.6  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0049  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.45 
 
 
503 aa  51.6  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.492583  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  22.19 
 
 
589 aa  51.2  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  23.71 
 
 
581 aa  51.2  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0892  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.28 
 
 
330 aa  51.2  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000556598  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  21.23 
 
 
740 aa  50.8  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  24.2 
 
 
764 aa  50.8  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3549  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 
421 aa  50.8  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66638  glucose repression mediator protein  23.44 
 
 
815 aa  50.8  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  24.05 
 
 
4079 aa  50.8  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  25.74 
 
 
643 aa  50.4  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.74 
 
 
988 aa  50.4  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.55 
 
 
1056 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0823  TPR repeat-containing protein  25.49 
 
 
502 aa  50.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  22.16 
 
 
567 aa  50.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  23.37 
 
 
673 aa  50.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  22.66 
 
 
465 aa  50.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0768  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 
258 aa  50.4  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.638517  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  21.06 
 
 
2401 aa  49.7  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  22.26 
 
 
804 aa  48.9  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0616  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.91 
 
 
647 aa  49.3  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.1691e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  21.58 
 
 
882 aa  49.7  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0003  TPR repeat-containing protein  20.71 
 
 
466 aa  49.3  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  26.11 
 
 
681 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  26.14 
 
 
505 aa  49.7  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2822  tetratricopeptide repeat-containing protein  27.69 
 
 
290 aa  49.3  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0986349  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  23.27 
 
 
409 aa  49.7  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 
767 aa  48.9  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  24.91 
 
 
632 aa  48.9  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003023  putative heat shock protein  26.59 
 
 
373 aa  48.9  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000120972  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  22.45 
 
 
3301 aa  48.9  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 
265 aa  48.9  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  25.28 
 
 
1764 aa  48.9  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  21.62 
 
 
827 aa  48.5  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0195  TPR domain protein  24.08 
 
 
379 aa  48.5  0.0004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.315867  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  21.83 
 
 
883 aa  48.5  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  22.58 
 
 
882 aa  48.5  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>