113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0258 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0258  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 974 aa  1971    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0685  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  49.16 
 
 		 883 aa  287  5e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0651  TPR repeat-containing protein  49.32 
 
 		 878 aa  280  8e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10746  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4380  TPR repeat-containing protein  42.54 
 
 		 900 aa  149  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2071  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 		 757 aa  148  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1322  TPR repeat-containing protein  39.9 
 
 		 627 aa  144  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.993956  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2961  Tetratricopeptide domain protein  38.34 
 
 		 635 aa  137  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.445649 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1698  TPR domain-containing protein  36.84 
 
 		 626 aa  136  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1635  TPR repeat-containing protein  34.2 
 
 		 665 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0192476  normal  0.892457 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1302  TPR domain-containing protein  28.05 
 
 		 846 aa  120  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0646  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 611 aa  119  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0665559  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1260  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 		 616 aa  106  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.126899  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0696  TPR repeat-containing protein  31.98 
 
 		 893 aa  106  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1146  TPR repeat-containing protein  22.01 
 
 		 1091 aa  80.5  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000383652 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  23.25 
 
 		 878 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2338  Tetratricopeptide TPR_4  28.82 
 
 		 1089 aa  73.9  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.878035  normal  0.026565 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3987  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 		 1092 aa  71.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.017736 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.41 
 
 		 639 aa  69.3  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.62 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  21.85 
 
 		 810 aa  67.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0090  TPR repeat-containing protein  23.3 
 
 		 1090 aa  62.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.763002  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  22.51 
 
 		 567 aa  61.6  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  21.71 
 
 		 673 aa  57.8  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  19.87 
 
 		 3172 aa  57.4  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  23.89 
 
 		 402 aa  57.4  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  25.86 
 
 		 340 aa  57  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  24.6 
 
 		 1737 aa  56.6  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.23 
 
 		 689 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  23.68 
 
 		 864 aa  56.2  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  23.66 
 
 		 860 aa  55.8  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 		 3145 aa  55.8  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4615  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.65 
 
 		 1402 aa  54.7  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  20.9 
 
 		 3301 aa  54.3  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  24.55 
 
 		 750 aa  53.9  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  21.43 
 
 		 1676 aa  54.3  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  23.43 
 
 		 968 aa  53.5  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.62 
 
 		 1056 aa  53.5  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  21.88 
 
 		 1252 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.84 
 
 		 632 aa  53.5  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02410  general transcriptional repressor, putative  19.68 
 
 		 1101 aa  52.8  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  22.87 
 
 		 1486 aa  53.1  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  21.88 
 
 		 1252 aa  53.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  24.51 
 
 		 638 aa  52.4  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  21.04 
 
 		 992 aa  52  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 		 542 aa  52  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 		 883 aa  51.6  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  23.75 
 
 		 884 aa  51.6  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  24.69 
 
 		 1138 aa  50.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  24.4 
 
 		 448 aa  50.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  22.05 
 
 		 847 aa  51.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  24.7 
 
 		 486 aa  50.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  20 
 
 		 1154 aa  50.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2550  TPR repeat-containing protein  22.87 
 
 		 670 aa  50.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.507483  normal  0.0818134 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0032  TPR repeat-containing protein  23.26 
 
 		 1445 aa  50.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.19 
 
 		 818 aa  50.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0583  diguanylate cyclase with GAF sensor  23.72 
 
 		 870 aa  49.3  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.958543 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2167  tetratricopeptide TPR_2  20.6 
 
 		 1014 aa  49.7  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.796808 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  21.86 
 
 		 632 aa  49.3  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  23.27 
 
 		 265 aa  49.7  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3398  TPR repeat-containing protein  22.99 
 
 		 274 aa  49.7  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0527752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  22.41 
 
 		 808 aa  49.7  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0304  TPR repeat-containing protein  23.86 
 
 		 324 aa  49.7  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000296078  hitchhiker  0.00226693 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2008  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.03 
 
 		 730 aa  49.7  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.196869  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.22 
 
 		 1022 aa  49.7  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.49 
 
 		 784 aa  49.7  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.4 
 
 		 363 aa  49.3  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 		 2262 aa  49.3  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  21.05 
 
 		 681 aa  48.5  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0031  TPR repeat-containing protein  24.83 
 
 		 522 aa  48.9  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.4 
 
 		 363 aa  48.9  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  26.56 
 
 		 875 aa  48.5  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 423 aa  48.5  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.71 
 
 		 988 aa  48.1  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  34.02 
 
 		 750 aa  48.1  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.42 
 
 		 293 aa  48.1  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  18.45 
 
 		 573 aa  48.1  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  24.05 
 
 		 643 aa  47.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0828  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 		 886 aa  47.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  22.28 
 
 		 436 aa  47.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  22.37 
 
 		 722 aa  47.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  23.78 
 
 		 887 aa  47.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  23.28 
 
 		 936 aa  47.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  28.81 
 
 		 623 aa  47.8  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  27.65 
 
 		 456 aa  47.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3116  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.46 
 
 		 878 aa  47  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2041  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.63 
 
 		 884 aa  47  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.443497 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0600  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 		 1112 aa  47  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.272318  normal  0.386774 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  20.54 
 
 		 614 aa  46.2  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  22.87 
 
 		 762 aa  46.2  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  23.7 
 
 		 725 aa  45.8  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0774  TPR repeat-containing protein  23.12 
 
 		 1534 aa  45.8  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2761  TPR repeat-containing protein  25.2 
 
 		 468 aa  45.8  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.594013  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2393  TPR repeat-containing protein  24.94 
 
 		 944 aa  45.8  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1957  hypothetical protein  23.05 
 
 		 475 aa  45.4  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00211883  hitchhiker  0.00150316 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.18 
 
 		 557 aa  45.4  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0419  TPR repeat-containing protein  21.33 
 
 		 224 aa  45.4  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.338331  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0116  TPR repeat-containing protein  19.24 
 
 		 289 aa  45.4  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  20.82 
 
 		 1069 aa  45.1  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3752  TPR repeat-containing protein  46 
 
 		 473 aa  45.1  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  21.48 
 
 		 505 aa  45.1  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>