131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4380 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4380  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 900 aa  1837    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0258  TPR repeat-containing protein  42.54 
 
 		 974 aa  149  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0685  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.65 
 
 		 883 aa  136  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1698  TPR domain-containing protein  30.93 
 
 		 626 aa  130  9.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0651  TPR repeat-containing protein  34.65 
 
 		 878 aa  127  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10746  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0696  TPR repeat-containing protein  32.45 
 
 		 893 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1635  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 		 665 aa  121  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0192476  normal  0.892457 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0646  TPR repeat-containing protein  27.39 
 
 		 611 aa  119  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0665559  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2071  TPR repeat-containing protein  27.65 
 
 		 757 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1322  TPR repeat-containing protein  31.79 
 
 		 627 aa  110  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.993956  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2961  Tetratricopeptide domain protein  30.15 
 
 		 635 aa  106  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.445649 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1302  TPR domain-containing protein  29.88 
 
 		 846 aa  95.5  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0583  diguanylate cyclase with GAF sensor  23.09 
 
 		 870 aa  88.6  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.958543 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1260  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 		 616 aa  87  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.126899  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  25.71 
 
 		 267 aa  66.2  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  21.48 
 
 		 3172 aa  65.9  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3987  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 1092 aa  65.1  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.017736 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.94 
 
 		 689 aa  64.7  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  25.1 
 
 		 561 aa  64.3  0.000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  25.1 
 
 		 561 aa  64.3  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1146  TPR repeat-containing protein  28.49 
 
 		 1091 aa  62.4  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000383652 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  26 
 
 		 718 aa  62  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  22.86 
 
 		 265 aa  62  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  22.13 
 
 		 436 aa  61.2  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.17 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2590  hypothetical protein  29.73 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.640776  normal  0.115316 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2338  Tetratricopeptide TPR_4  25.27 
 
 		 1089 aa  60.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.878035  normal  0.026565 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  23.05 
 
 		 1069 aa  60.5  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  22.79 
 
 		 968 aa  58.9  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  25.39 
 
 		 638 aa  58.5  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27 
 
 		 624 aa  58.5  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  25.76 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3161  tetratricopeptide TPR_2  24 
 
 		 444 aa  57.4  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1154  TPR repeat-containing protein  23.98 
 
 		 511 aa  57.4  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  24.6 
 
 		 729 aa  57  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  23.41 
 
 		 3301 aa  56.6  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1957  hypothetical protein  24.35 
 
 		 475 aa  57  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00211883  hitchhiker  0.00150316 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0090  TPR repeat-containing protein  24.55 
 
 		 1090 aa  55.5  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.763002  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4615  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.71 
 
 		 1402 aa  55.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  26.19 
 
 		 1611 aa  55.1  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.69 
 
 		 878 aa  55.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  22.79 
 
 		 632 aa  55.1  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  24.33 
 
 		 2262 aa  55.1  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  26.55 
 
 		 732 aa  54.3  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  20.83 
 
 		 3145 aa  54.3  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1998  uncharacterized protein involved in fimbrial biogenesis  27.91 
 
 		 267 aa  53.9  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.151418 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  22.32 
 
 		 577 aa  53.1  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.26 
 
 		 810 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1443  hypothetical protein  31.15 
 
 		 460 aa  53.5  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.113493  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0616  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.34 
 
 		 647 aa  53.1  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.1691e-34 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  21.68 
 
 		 577 aa  52.4  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  23.03 
 
 		 847 aa  52.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  25.29 
 
 		 883 aa  52.4  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4601  TPR repeat-containing protein  25.15 
 
 		 398 aa  52.4  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.458402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3368  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.46 
 
 		 503 aa  52.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00879958  normal  0.135189 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  22.14 
 
 		 448 aa  51.6  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.73 
 
 		 645 aa  50.8  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000607684  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  23.14 
 
 		 448 aa  50.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  23.67 
 
 		 1421 aa  50.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  21.82 
 
 		 265 aa  51.2  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  20.58 
 
 		 375 aa  50.4  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  24.41 
 
 		 2262 aa  50.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  23.89 
 
 		 1138 aa  49.7  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0911  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 		 515 aa  50.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.19098  hitchhiker  0.00518464 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  22.8 
 
 		 597 aa  50.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0991  TPR repeat-containing protein  22.08 
 
 		 357 aa  49.7  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161827  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  20.66 
 
 		 864 aa  49.3  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  21.73 
 
 		 1213 aa  49.3  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  19.83 
 
 		 1486 aa  49.3  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3372  TPR repeat-containing protein  23.2 
 
 		 4095 aa  49.3  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.56 
 
 		 818 aa  49.3  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.28 
 
 		 639 aa  49.3  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  24.68 
 
 		 626 aa  48.9  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  24.68 
 
 		 626 aa  48.9  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  22.74 
 
 		 519 aa  48.9  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  24.68 
 
 		 614 aa  48.9  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  24.68 
 
 		 614 aa  48.9  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 		 614 aa  48.9  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 		 614 aa  48.9  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1139  TPR repeat-containing protein  22.08 
 
 		 357 aa  48.9  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000045072  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  21.92 
 
 		 1737 aa  48.5  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  22.82 
 
 		 808 aa  48.1  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  22.96 
 
 		 875 aa  48.1  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  21.74 
 
 		 573 aa  48.1  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.95 
 
 		 572 aa  47.8  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 934 aa  47.8  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  23.75 
 
 		 567 aa  47  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 		 804 aa  47.4  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4396  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.67 
 
 		 602 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1034  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.25 
 
 		 548 aa  47.4  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  22.55 
 
 		 4079 aa  47.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.18 
 
 		 784 aa  47.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.55 
 
 		 565 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  24.54 
 
 		 747 aa  47  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.4 
 
 		 572 aa  46.6  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  24.4 
 
 		 748 aa  46.6  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  26.35 
 
 		 832 aa  46.6  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  27.23 
 
 		 725 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1796  TPR repeat-containing protein  18.29 
 
 		 352 aa  47  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  20.33 
 
 		 279 aa  46.2  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>