40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1635 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1698  TPR domain-containing protein  54.1 
 
 		 626 aa  650    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1635  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 665 aa  1342    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0192476  normal  0.892457 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2071  TPR repeat-containing protein  38.05 
 
 		 757 aa  424  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1260  TPR repeat-containing protein  33.98 
 
 		 616 aa  320  6e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.126899  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0646  TPR repeat-containing protein  35.66 
 
 		 611 aa  312  1e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0665559  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2961  Tetratricopeptide domain protein  48.5 
 
 		 635 aa  204  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.445649 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1322  TPR repeat-containing protein  47 
 
 		 627 aa  203  6e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.993956  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1302  TPR domain-containing protein  30.54 
 
 		 846 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0258  TPR repeat-containing protein  34.2 
 
 		 974 aa  133  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0685  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.27 
 
 		 883 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4380  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 		 900 aa  120  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0696  TPR repeat-containing protein  30.04 
 
 		 893 aa  120  9e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0651  TPR repeat-containing protein  29.89 
 
 		 878 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10746  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  27.13 
 
 		 708 aa  54.7  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0583  diguanylate cyclase with GAF sensor  28.47 
 
 		 870 aa  50.8  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.958543 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.44 
 
 		 878 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1125  TPR domain-containing protein  31.3 
 
 		 457 aa  48.9  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  34.51 
 
 		 638 aa  48.1  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  23.94 
 
 		 725 aa  47.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.25 
 
 		 810 aa  47.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2338  Tetratricopeptide TPR_4  23.89 
 
 		 1089 aa  47  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.878035  normal  0.026565 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 		 643 aa  47  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.81 
 
 		 1056 aa  46.6  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  24.65 
 
 		 685 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.31 
 
 		 364 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 		 847 aa  46.6  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  26.19 
 
 		 957 aa  45.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5176  family 2 glycosyl transferase  24.34 
 
 		 434 aa  45.4  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.634801  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1578  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.89 
 
 		 602 aa  45.4  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000346283  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3428  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 250 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 		 567 aa  45.4  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3368  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.98 
 
 		 503 aa  45.4  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00879958  normal  0.135189 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.36 
 
 		 1737 aa  45.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0090  TPR repeat-containing protein  24.16 
 
 		 1090 aa  44.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.763002  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28.69 
 
 		 3145 aa  44.7  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0196  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 		 927 aa  45.1  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  28.17 
 
 		 632 aa  44.7  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1520  Tetratricopeptide repeat protein  36.07 
 
 		 230 aa  44.7  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3891  photosystem I assembly protein Ycf3  29.79 
 
 		 196 aa  44.7  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3446  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 234 aa  43.9  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>