114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0651 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0651  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
878 aa  1689    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10746  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0685  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  90.4 
 
 
883 aa  1264    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0696  TPR repeat-containing protein  65.62 
 
 
893 aa  562  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0258  TPR repeat-containing protein  42.17 
 
 
974 aa  348  3e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4380  TPR repeat-containing protein  34.65 
 
 
900 aa  135  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2071  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 
757 aa  135  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1302  TPR domain-containing protein  28.09 
 
 
846 aa  127  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1698  TPR domain-containing protein  32.56 
 
 
626 aa  124  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0646  TPR repeat-containing protein  30.04 
 
 
611 aa  120  7.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0665559  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1635  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 
665 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0192476  normal  0.892457 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1322  TPR repeat-containing protein  34.34 
 
 
627 aa  118  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.993956  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2961  Tetratricopeptide domain protein  33.17 
 
 
635 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.445649 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1260  TPR repeat-containing protein  29.96 
 
 
616 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.126899  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  21.86 
 
 
810 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  21.22 
 
 
878 aa  63.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3987  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 
1092 aa  61.6  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.017736 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2338  Tetratricopeptide TPR_4  26.06 
 
 
1089 aa  61.2  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.878035  normal  0.026565 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.08 
 
 
358 aa  59.7  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.61 
 
 
818 aa  59.7  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  23.37 
 
 
1676 aa  58.5  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  22.62 
 
 
1069 aa  56.2  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1146  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 
1091 aa  56.6  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000383652 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  29.45 
 
 
3145 aa  56.2  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 
3172 aa  55.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  30.83 
 
 
267 aa  55.1  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  26.15 
 
 
3301 aa  55.1  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  24.92 
 
 
2262 aa  54.3  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.04 
 
 
557 aa  54.3  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.55 
 
 
784 aa  53.9  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  28.24 
 
 
638 aa  53.1  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  28.34 
 
 
340 aa  53.5  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4054  sporulation domain-containing protein  30.63 
 
 
538 aa  53.5  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3443  methyltransferase type 12  28.57 
 
 
436 aa  53.1  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0605302 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  25.83 
 
 
2262 aa  53.5  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 
605 aa  53.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 
1737 aa  52.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  27.54 
 
 
725 aa  52.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  25.57 
 
 
1611 aa  52.8  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.88 
 
 
689 aa  52.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0419  TPR repeat-containing protein  22.63 
 
 
224 aa  52.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.338331  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2761  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 
468 aa  52  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.594013  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3368  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.06 
 
 
503 aa  52  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00879958  normal  0.135189 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3718  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.97 
 
 
616 aa  51.2  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0090  TPR repeat-containing protein  21.99 
 
 
1090 aa  50.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.763002  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.77 
 
 
632 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  25.37 
 
 
561 aa  50.4  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  25.37 
 
 
561 aa  49.7  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  29.12 
 
 
311 aa  49.3  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  26.45 
 
 
828 aa  49.3  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3814  TPR repeat-containing protein  23.37 
 
 
615 aa  49.3  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1812  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.34 
 
 
406 aa  49.7  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.312909  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  24.06 
 
 
279 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  22.96 
 
 
629 aa  48.5  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.11 
 
 
1022 aa  48.1  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  22.97 
 
 
1406 aa  47.8  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  22.57 
 
 
792 aa  48.1  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  18.44 
 
 
992 aa  47.4  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0964  TPR and WD-40 repeat-containing protein  27.2 
 
 
506 aa  47.4  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.907164 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 
412 aa  47.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  24.32 
 
 
265 aa  47.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
1421 aa  47.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  22.43 
 
 
968 aa  47.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  20.37 
 
 
279 aa  47.4  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2590  hypothetical protein  27.86 
 
 
225 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.640776  normal  0.115316 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 
762 aa  47.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 
592 aa  47.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.45 
 
 
265 aa  47.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 
1060 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  31.25 
 
 
626 aa  46.6  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3311  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 
4074 aa  46.6  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  35.71 
 
 
620 aa  46.6  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  25.2 
 
 
804 aa  46.6  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 
639 aa  46.6  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  23.99 
 
 
505 aa  46.2  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  26.55 
 
 
883 aa  46.6  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.26 
 
 
1056 aa  47  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1106  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
371 aa  46.2  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.178209 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.71 
 
 
1056 aa  45.8  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
615 aa  45.8  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2735  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 
384 aa  45.8  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3455  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.32 
 
 
4104 aa  46.2  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  25.9 
 
 
632 aa  45.8  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  27.13 
 
 
632 aa  45.8  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  25.23 
 
 
585 aa  45.4  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  23.95 
 
 
573 aa  45.4  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  20.83 
 
 
448 aa  45.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  21.9 
 
 
567 aa  45.4  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  29.5 
 
 
725 aa  45.4  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 
643 aa  45.4  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2066  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.94 
 
 
257 aa  45.4  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.585101  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  23.11 
 
 
883 aa  45.1  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  20.72 
 
 
1486 aa  45.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4143  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.83 
 
 
2837 aa  45.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0473869 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.7 
 
 
988 aa  45.1  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 
566 aa  45.1  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4615  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 
1402 aa  44.7  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 
620 aa  44.7  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  24.26 
 
 
648 aa  44.7  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  22.18 
 
 
732 aa  44.7  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  31.94 
 
 
265 aa  44.7  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>