51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1302 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1302  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 846 aa  1696    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1698  TPR domain-containing protein  35.74 
 
 		 626 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2071  TPR repeat-containing protein  31.56 
 
 		 757 aa  174  9e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1260  TPR repeat-containing protein  34.08 
 
 		 616 aa  160  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.126899  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0646  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 611 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0665559  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1635  TPR repeat-containing protein  30.54 
 
 		 665 aa  148  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0192476  normal  0.892457 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2961  Tetratricopeptide domain protein  42.6 
 
 		 635 aa  148  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.445649 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1322  TPR repeat-containing protein  40.83 
 
 		 627 aa  145  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.993956  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0685  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.13 
 
 		 883 aa  127  7e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0696  TPR repeat-containing protein  31.97 
 
 		 893 aa  125  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0651  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 		 878 aa  124  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10746  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0258  TPR repeat-containing protein  28.05 
 
 		 974 aa  120  9e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4380  TPR repeat-containing protein  29.88 
 
 		 900 aa  95.1  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1443  hypothetical protein  27.03 
 
 		 460 aa  62.4  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.113493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25 
 
 		 810 aa  56.2  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0003  TPR repeat-containing protein  24.31 
 
 		 466 aa  55.5  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1146  TPR repeat-containing protein  26.04 
 
 		 1091 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000383652 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3368  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.02 
 
 		 503 aa  53.5  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00879958  normal  0.135189 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 		 878 aa  52  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  22.5 
 
 		 3145 aa  51.6  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.81 
 
 		 358 aa  51.2  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3987  TPR repeat-containing protein  25.44 
 
 		 1092 aa  50.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.017736 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 		 632 aa  50.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  28.66 
 
 		 729 aa  50.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 		 311 aa  49.7  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  25.44 
 
 		 340 aa  49.3  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  26.81 
 
 		 860 aa  48.9  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  21.72 
 
 		 979 aa  48.5  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2338  Tetratricopeptide TPR_4  24.53 
 
 		 1089 aa  48.1  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.878035  normal  0.026565 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  32.52 
 
 		 754 aa  47.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1476  TPR repeat-containing protein  27.65 
 
 		 226 aa  47.4  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818932  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  30.7 
 
 		 643 aa  47.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3645  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 		 266 aa  46.6  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0583  diguanylate cyclase with GAF sensor  26.71 
 
 		 870 aa  46.2  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.958543 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0532  tetratricopeptide TPR_4  28.42 
 
 		 2679 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  25.7 
 
 		 573 aa  46.6  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  28.95 
 
 		 733 aa  46.2  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1609  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 		 194 aa  46.2  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.994867  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  30.21 
 
 		 585 aa  45.8  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  28.75 
 
 		 1764 aa  46.2  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  24.91 
 
 		 1737 aa  45.4  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4604  protein kinase  30.28 
 
 		 545 aa  45.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  23.2 
 
 		 3172 aa  45.4  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  23.2 
 
 		 3301 aa  45.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 265 aa  45.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  32.11 
 
 		 4079 aa  45.4  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  21.77 
 
 		 1069 aa  45.1  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4573  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.77 
 
 		 3590 aa  44.7  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 		 754 aa  44.7  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3371  glycosyl transferase family protein  33.73 
 
 		 396 aa  44.3  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.547122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  24.21 
 
 		 725 aa  44.3  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>