27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0646 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0646  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 611 aa  1233    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0665559  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1260  TPR repeat-containing protein  43.28 
 
 		 616 aa  457  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.126899  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1698  TPR domain-containing protein  35.1 
 
 		 626 aa  327  6e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1635  TPR repeat-containing protein  34.47 
 
 		 665 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0192476  normal  0.892457 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2071  TPR repeat-containing protein  41.81 
 
 		 757 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1322  TPR repeat-containing protein  48.23 
 
 		 627 aa  194  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.993956  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2961  Tetratricopeptide domain protein  50 
 
 		 635 aa  189  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.445649 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1302  TPR domain-containing protein  30.97 
 
 		 846 aa  155  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0685  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.74 
 
 		 883 aa  125  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0696  TPR repeat-containing protein  28.62 
 
 		 893 aa  120  6e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0258  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 974 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4380  TPR repeat-containing protein  27.39 
 
 		 900 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0651  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 878 aa  114  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10746  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1443  hypothetical protein  30.58 
 
 		 460 aa  59.3  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.113493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1146  TPR repeat-containing protein  24.32 
 
 		 1091 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000383652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3987  TPR repeat-containing protein  23.78 
 
 		 1092 aa  53.9  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.017736 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2338  Tetratricopeptide TPR_4  30.84 
 
 		 1089 aa  52.4  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.878035  normal  0.026565 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1712  TPR repeat-containing protein  23.49 
 
 		 817 aa  48.9  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.347733  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0562  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 		 396 aa  47.8  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  25.5 
 
 		 827 aa  47.4  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  20.36 
 
 		 1737 aa  47.4  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0781  TPR domain-containing protein  21.25 
 
 		 924 aa  44.7  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.55707  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0583  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.3 
 
 		 870 aa  44.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.958543 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  24.85 
 
 		 436 aa  44.3  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  34.12 
 
 		 864 aa  44.3  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3833  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 446 aa  44.3  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117065  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 		 955 aa  44.3  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>