More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0583 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0583  diguanylate cyclase with GAF sensor  100 
 
 		 870 aa  1791    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.958543 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3072  diguanylate cyclase  28.51 
 
 		 356 aa  92.8  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000986718 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1202  diguanylate cyclase  28.51 
 
 		 356 aa  92.4  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0240122  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1805  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  24.21 
 
 		 960 aa  91.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0995  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.39 
 
 		 792 aa  86.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.37011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4380  TPR repeat-containing protein  23.09 
 
 		 900 aa  86.7  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0319  diguanylate cyclase  30.26 
 
 		 732 aa  85.9  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2258  diguanylate cyclase  26.52 
 
 		 353 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000122425  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3816  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  26.69 
 
 		 797 aa  83.2  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.250791  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  24.79 
 
 		 1073 aa  79.3  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1949  diguanylate cyclase  25.91 
 
 		 733 aa  78.2  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1870  GGDEF domain-containing protein  25.53 
 
 		 342 aa  77.4  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1721  diguanylate cyclase  25.34 
 
 		 483 aa  77.4  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.176219  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1355  diguanylate cyclase  26.94 
 
 		 487 aa  76.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.133394  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3673  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  27.13 
 
 		 1262 aa  77  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1281  diguanylate cyclase with GAF sensor  24.09 
 
 		 586 aa  75.5  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5111  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  26.69 
 
 		 479 aa  75.5  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0057  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  25.4 
 
 		 550 aa  75.1  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1214  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.35 
 
 		 496 aa  74.3  0.000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.302028  hitchhiker  0.0000035245 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0743  diguanylate cyclase  24.66 
 
 		 680 aa  74.3  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2458  diguanylate cyclase  32.11 
 
 		 343 aa  73.9  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1282  diguanylate cyclase with GAF sensor  24.02 
 
 		 550 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000101268  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2083  diguanylate cyclase  26.67 
 
 		 568 aa  73.9  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.17301  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3068  diguanylate cyclase  29.87 
 
 		 516 aa  73.2  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608977 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2704  diguanylate cyclase with GAF sensor  26.94 
 
 		 494 aa  72.8  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0570321  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2497  diguanylate cyclase with GAF sensor  26.06 
 
 		 355 aa  73.6  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000595067  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1750  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  22.88 
 
 		 896 aa  73.2  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.42554 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3979  diguanylate cyclase with GAF sensor  26.36 
 
 		 567 aa  73.2  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000058301  hitchhiker  0.000000371669 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1298  diguanylate cyclase with GAF sensor  24.34 
 
 		 353 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000090214  hitchhiker  0.00354722 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4523  diguanylate cyclase with GAF sensor  25.56 
 
 		 499 aa  72.4  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.967133  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1174  diguanylate cyclase  29.73 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3577  GGDEF domain-containing protein  27.66 
 
 		 322 aa  70.5  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.635523  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0620  diguanylate cyclase  26.75 
 
 		 517 aa  70.5  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0089586 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0817  diguanylate cyclase  24.85 
 
 		 1826 aa  70.5  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1741  diguanylate cyclase  26.69 
 
 		 374 aa  69.7  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.564976  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0299  hypothetical protein  24.66 
 
 		 609 aa  69.7  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3614  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.81 
 
 		 310 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3833  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.48 
 
 		 732 aa  69.3  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1323  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  26.82 
 
 		 441 aa  68.9  0.0000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0283  hypothetical protein  24.66 
 
 		 709 aa  68.9  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2534  diguanylate cyclase with GAF sensor  26.25 
 
 		 421 aa  68.9  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.657544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14870  diguanylate cyclase  26.84 
 
 		 462 aa  68.9  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.024895  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1483  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.11 
 
 		 335 aa  68.6  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.882912  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3525  diguanylate cyclase  31.09 
 
 		 227 aa  68.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.395826  normal  0.08798 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01741  Putative CHASE3/GGDEF domain-containing signal protein  24.7 
 
 		 563 aa  68.2  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3168  diguanylate cyclase  28.14 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12380  diguanylate cyclase  25.49 
 
 		 499 aa  68.2  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00534046  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4207  GGDEF domain-containing protein  29.52 
 
 		 625 aa  67.8  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2842  diguanylate cyclase  27.27 
 
 		 785 aa  67.8  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1844  diguanylate cyclase with GAF sensor  24.22 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0773  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.32 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0895  GAF domain/GGDEF domain-containing protein  25.11 
 
 		 688 aa  67  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0310961  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0985  diguanylate cyclase  28.29 
 
 		 508 aa  67.4  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2470  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.01 
 
 		 756 aa  67.4  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.578353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3659  diguanylate cyclase with GAF sensor  23.64 
 
 		 362 aa  67  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1431  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  23.81 
 
 		 625 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0701  diguanylate cyclase  26.72 
 
 		 650 aa  66.6  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.291224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1511  diguanylate cyclase with GAF sensor  23.21 
 
 		 557 aa  66.2  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00005186  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7079  serine/threonine protein kinase  24.9 
 
 		 1643 aa  66.6  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1051  diguanylate cyclase  29.7 
 
 		 424 aa  66.6  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1136  diguanylate cyclase  27.65 
 
 		 582 aa  66.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21320  diguanylate cyclase  23.25 
 
 		 510 aa  66.6  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4131  diguanylate cyclase  27.76 
 
 		 369 aa  65.9  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0802  diguanylate cyclase  26.42 
 
 		 321 aa  65.9  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0165  diguanylate cyclase with GAF sensor  25.2 
 
 		 710 aa  65.9  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0418  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  22.97 
 
 		 572 aa  65.9  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0034  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.19 
 
 		 728 aa  65.9  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0808  GGDEF domain-containing protein  29.76 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792512  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0486  diguanylate cyclase  28.16 
 
 		 738 aa  65.5  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1471  diguanylate cyclase  26.58 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1433  diguanylate cyclase  27.33 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.58748  normal  0.153521 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1339  diguanylate cyclase  25.93 
 
 		 436 aa  64.7  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2156  diguanylate cyclase  26.01 
 
 		 470 aa  65.1  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.117189 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0785  diguanylate cyclase with GAF sensor  25.32 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0690  diguanylate cyclase  25.13 
 
 		 471 aa  64.7  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2425  diguanylate cyclase  25.13 
 
 		 353 aa  64.7  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  24.89 
 
 		 792 aa  64.7  0.000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2679  diguanylate cyclase  29.27 
 
 		 459 aa  64.3  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4930  diguanylate cyclase  28.88 
 
 		 530 aa  64.7  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.22973 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0330  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  26.37 
 
 		 531 aa  64.7  0.000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1411  GGDEF domain-containing protein  26.74 
 
 		 493 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0895588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0953  diguanylate cyclase  24.62 
 
 		 494 aa  64.3  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1387  diguanylate cyclase  26.38 
 
 		 336 aa  63.9  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.617999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  24.89 
 
 		 841 aa  63.9  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2721  diguanylate cyclase with GAF sensor  24.45 
 
 		 686 aa  63.9  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.53529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2350  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  26.47 
 
 		 1000 aa  64.3  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.521127 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2096  diguanylate cyclase with GAF sensor  25.83 
 
 		 664 aa  63.9  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.76184 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3097  diguanylate cyclase  28.04 
 
 		 458 aa  64.3  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.948135  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1752  diguanylate cyclase  25.99 
 
 		 718 aa  63.5  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.972307  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1315  diguanylate cyclase  25.13 
 
 		 608 aa  63.9  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243862  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0926  diguanylate cyclase  24.62 
 
 		 494 aa  64.3  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0115  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  26.63 
 
 		 304 aa  63.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.113218  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1165  diguanylate cyclase  28.34 
 
 		 459 aa  63.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000192138 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5066  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.12 
 
 		 338 aa  62.8  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0133  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.49 
 
 		 461 aa  63.5  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2111  diguanylate cyclase  28.14 
 
 		 392 aa  63.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1457  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  23.47 
 
 		 624 aa  62.4  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.659998  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1658  response regulator/GGDEF domain-containing protein  26.5 
 
 		 458 aa  62.4  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.939598  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3032  diguanylate cyclase  27.47 
 
 		 547 aa  62.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2986  diguanylate cyclase  25.41 
 
 		 352 aa  62.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0275567 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>