More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3032 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3032  diguanylate cyclase  100 
 
 		 547 aa  1122    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1328  diguanylate cyclase  48.31 
 
 		 648 aa  507  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5745  hypothetical protein  57.75 
 
 		 384 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4264  Toll-interleukin receptor  50.76 
 
 		 627 aa  360  3e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3861  hypothetical protein  50.3 
 
 		 450 aa  355  8.999999999999999e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.124994 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4878  hypothetical protein  51.37 
 
 		 457 aa  352  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4253  serine/threonine protein kinase  47.79 
 
 		 662 aa  350  3e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.340258  normal  0.0204039 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4407  hypothetical protein  46.4 
 
 		 475 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.684073 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2208  serine/threonine protein kinase  49.27 
 
 		 877 aa  344  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.177654 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2972  hypothetical protein  50 
 
 		 537 aa  343  5e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1625  hypothetical protein  46.27 
 
 		 466 aa  342  7e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.236851 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1512  TIR protein  52.27 
 
 		 638 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00867702 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3967  hypothetical protein  47.73 
 
 		 446 aa  320  5e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3808  hypothetical protein  48.93 
 
 		 456 aa  317  4e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1449  hypothetical protein  46.13 
 
 		 456 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1420  hypothetical protein  46.13 
 
 		 456 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2158  hypothetical protein  46.57 
 
 		 456 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.621981 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2114  hypothetical protein  46.57 
 
 		 456 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4814  hypothetical protein  47.46 
 
 		 534 aa  298  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592191  normal  0.650141 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1168  TIR protein  46.27 
 
 		 520 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3060  hypothetical protein  47.35 
 
 		 405 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232176 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5742  hypothetical protein  46.01 
 
 		 470 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3077  toll-interleukin receptor  43.34 
 
 		 623 aa  287  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783629 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0813  hypothetical protein  36.78 
 
 		 491 aa  226  6e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5066  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  50.25 
 
 		 338 aa  209  7e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0227  hypothetical protein  37.28 
 
 		 438 aa  208  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2160  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  50.79 
 
 		 732 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2222  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  50.26 
 
 		 732 aa  193  8e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.513474  normal  0.0596169 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5086  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.09 
 
 		 465 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2052  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  49.74 
 
 		 481 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1805  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  51.98 
 
 		 960 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3673  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  52.81 
 
 		 1262 aa  188  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2076  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  49.74 
 
 		 481 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00773841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0847  two component diguanylate cyclase  51.96 
 
 		 327 aa  186  7e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3819  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  49.46 
 
 		 660 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3770  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  49.46 
 
 		 660 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1516  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  47.78 
 
 		 352 aa  185  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0065858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2062  diguanylate cyclase  52.35 
 
 		 620 aa  183  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.502085 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  49.72 
 
 		 337 aa  183  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.32327  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0019  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  49.46 
 
 		 341 aa  182  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0416556  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16500  two-component response regulator  45.96 
 
 		 347 aa  182  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.67066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2499  GGDEF domain-containing protein  50.29 
 
 		 367 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4149  diguanylate cyclase  48.15 
 
 		 591 aa  181  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0015025  normal  0.169582 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1030  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  50 
 
 		 330 aa  180  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.33399 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3470  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  46.45 
 
 		 353 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843913  normal  0.949354 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0984  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  52.57 
 
 		 353 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.194443 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1436  two-component response regulator  45.45 
 
 		 327 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462819  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4311  diguanylate cyclase  47.73 
 
 		 354 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.750548  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4055  diguanylate cyclase  47.73 
 
 		 354 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3956  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  48.86 
 
 		 357 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.892783  normal  0.485051 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1597  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  48.86 
 
 		 313 aa  178  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5111  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  50 
 
 		 479 aa  178  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1713  diguanylate cyclase  48.63 
 
 		 462 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0095  putative sensory transduction system, regulatory protein  48.89 
 
 		 536 aa  177  5e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.348008  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3449  diguanylate cyclase  48.3 
 
 		 357 aa  177  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.103484 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0133  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  47.73 
 
 		 461 aa  176  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2955  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  49.44 
 
 		 308 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2018  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  47.73 
 
 		 355 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414914  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1738  diguanylate cyclase  48.63 
 
 		 462 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4535  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  48.86 
 
 		 345 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0387275  normal  0.636684 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2357  diguanylate cyclase  49.12 
 
 		 252 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1099  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  47.73 
 
 		 334 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3170  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  47.73 
 
 		 344 aa  172  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.103544 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1431  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  45.63 
 
 		 625 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1622  response regulator receiver protein  45.5 
 
 		 641 aa  171  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.923164  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0371  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.51 
 
 		 890 aa  172  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1457  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  45.15 
 
 		 624 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.659998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1341  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  47.02 
 
 		 319 aa  171  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0362  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  45.93 
 
 		 890 aa  171  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.190279  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5389  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  46.89 
 
 		 372 aa  171  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4228  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  47.16 
 
 		 334 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3973  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  46.11 
 
 		 362 aa  171  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.415221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3671  putative signaling protein  46.2 
 
 		 480 aa  171  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2812  diguanylate cyclase  49.4 
 
 		 315 aa  170  5e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0709  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.4 
 
 		 322 aa  171  5e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.169559 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4124  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  47.73 
 
 		 334 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.113929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1949  sensory box/GGDEF family protein  45.76 
 
 		 579 aa  170  6e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.773832  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1471  diguanylate cyclase  42.08 
 
 		 339 aa  170  7e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.435801  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004464  sensory box/GGDEF family protein  48.3 
 
 		 582 aa  170  7e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.845527  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00930  hypothetical protein  48.85 
 
 		 581 aa  170  7e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0414  diguanylate cyclase  45.6 
 
 		 346 aa  169  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4407  GGDEF family protein  46.56 
 
 		 344 aa  169  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1494  response regulator/GGDEF domain-containing protein  46.59 
 
 		 335 aa  169  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.799611 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1684  GGDEF domain-containing protein  45.45 
 
 		 323 aa  168  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1058  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  46.02 
 
 		 333 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0856452  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1974  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  46.46 
 
 		 340 aa  168  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.098619 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1499  response regulator/GGDEF domain protein  46.89 
 
 		 334 aa  167  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1309  GGDEF  46.89 
 
 		 334 aa  167  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365402 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1840  putative transmembrane transcriptional sensor regulator  46.37 
 
 		 506 aa  167  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0399375  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2096  diguanylate cyclase with GAF sensor  47.75 
 
 		 664 aa  167  5.9999999999999996e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.76184 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1645  hypothetical protein  45.7 
 
 		 344 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176846  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2607  GGDEF domain-containing protein  43.24 
 
 		 1054 aa  165  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202674  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0250  GGDEF domain-containing protein  45.81 
 
 		 489 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.164767  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0984  GGDEF domain-containing protein  45.81 
 
 		 489 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.184695  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0315  GGDEF domain-containing protein  45.81 
 
 		 484 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.237701  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0390  GGDEF domain-containing protein  45.81 
 
 		 499 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.817676  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1346  GGDEF domain-containing protein  45.81 
 
 		 499 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0669442  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1814  hypothetical protein  34.01 
 
 		 511 aa  165  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191783  hitchhiker  0.000537026 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1755  diguanylate cyclase  45.81 
 
 		 499 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3528  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.58 
 
 		 310 aa  164  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>