51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3077 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3077  toll-interleukin receptor  100 
 
 
623 aa  1274    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783629 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1512  TIR protein  37.54 
 
 
638 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00867702 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4264  Toll-interleukin receptor  38.45 
 
 
627 aa  391  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2208  serine/threonine protein kinase  37.89 
 
 
877 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.177654 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1168  TIR protein  36.42 
 
 
520 aa  336  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4878  hypothetical protein  41.8 
 
 
457 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3861  hypothetical protein  46.91 
 
 
450 aa  291  3e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.124994 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3032  diguanylate cyclase  43.34 
 
 
547 aa  287  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3967  hypothetical protein  39.78 
 
 
446 aa  287  5e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5745  hypothetical protein  42.21 
 
 
384 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2972  hypothetical protein  38.36 
 
 
537 aa  281  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1625  hypothetical protein  42.69 
 
 
466 aa  278  3e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.236851 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1449  hypothetical protein  41.38 
 
 
456 aa  273  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1420  hypothetical protein  41.38 
 
 
456 aa  273  6e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5742  hypothetical protein  41.95 
 
 
470 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4253  serine/threonine protein kinase  40.36 
 
 
662 aa  270  7e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.340258  normal  0.0204039 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4407  hypothetical protein  39.45 
 
 
475 aa  266  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.684073 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1328  diguanylate cyclase  42.77 
 
 
648 aa  264  4e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2114  hypothetical protein  39.28 
 
 
456 aa  257  5e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2158  hypothetical protein  39.28 
 
 
456 aa  257  5e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.621981 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3808  hypothetical protein  40.79 
 
 
456 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3060  hypothetical protein  37.88 
 
 
405 aa  246  6e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232176 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4814  hypothetical protein  34.26 
 
 
534 aa  246  8e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592191  normal  0.650141 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0813  hypothetical protein  35.29 
 
 
491 aa  229  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0227  hypothetical protein  33.52 
 
 
438 aa  196  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1808  TIR protein  26.71 
 
 
500 aa  183  6e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1814  hypothetical protein  33.23 
 
 
511 aa  160  6e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191783  hitchhiker  0.000537026 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  23.82 
 
 
1367 aa  76.6  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  26.58 
 
 
1209 aa  73.9  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  25.74 
 
 
1908 aa  73.9  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2507  putative Chase2 sensor protein  24.38 
 
 
902 aa  70.5  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  24.1 
 
 
1914 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1446  hypothetical protein  44.44 
 
 
117 aa  70.1  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.712743  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3607  putative Chase2 sensor protein  24.44 
 
 
902 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  26.05 
 
 
2077 aa  68.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  24.39 
 
 
1932 aa  66.2  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  25.41 
 
 
1214 aa  65.5  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4983  WD-40 repeat-containing protein  25.94 
 
 
891 aa  64.7  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.709938 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  23.66 
 
 
1190 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  21.31 
 
 
1477 aa  62.4  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3059  putative Chase2 sensor protein  22.91 
 
 
781 aa  61.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321518 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  22.64 
 
 
1176 aa  61.2  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  22.95 
 
 
1163 aa  61.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  24.37 
 
 
1177 aa  58.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5743  TPR repeat-containing protein  23.9 
 
 
335 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  27.27 
 
 
1161 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  27.27 
 
 
1161 aa  54.7  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  22.97 
 
 
1164 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1447  hypothetical protein  30.91 
 
 
129 aa  50.8  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.388571  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3946  hypothetical protein  23.03 
 
 
915 aa  43.9  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0598974  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4022  hypothetical protein  22.08 
 
 
854 aa  43.9  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.864107  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>