25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3946 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5276  ATPase  40.76 
 
 		 949 aa  681    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.089004 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3946  hypothetical protein  100 
 
 		 915 aa  1813    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0598974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4454  hypothetical protein  46.67 
 
 		 917 aa  655    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4445  hypothetical protein  28.88 
 
 		 850 aa  112  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1037  hypothetical protein  26.28 
 
 		 747 aa  95.5  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.148112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3080  hypothetical protein  28.24 
 
 		 259 aa  79.3  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.143929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1783  hypothetical protein  25.33 
 
 		 965 aa  79.7  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.614305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1261  N-6 DNA methylase  25.37 
 
 		 1362 aa  76.6  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1786  hypothetical protein  27.38 
 
 		 415 aa  73.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00688382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2382  TRD5  37.5 
 
 		 253 aa  67.4  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3670  cold-shock protein, DNA-binding  23.22 
 
 		 1555 aa  67  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0651926  decreased coverage  0.00853504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  40.91 
 
 		 3670 aa  67  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1787  hypothetical protein  26.22 
 
 		 642 aa  65.1  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.799835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40672  predicted protein  44.03 
 
 		 1034 aa  62.4  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1784  hypothetical protein  24 
 
 		 370 aa  60.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00387398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4718  extracellular ligand-binding receptor  21.24 
 
 		 1007 aa  53.9  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.87534 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0945  ATPase  21.39 
 
 		 364 aa  50.1  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  30.64 
 
 		 4191 aa  49.7  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5025  hypothetical protein  28.3 
 
 		 481 aa  48.5  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.898737  normal  0.21169 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  32.59 
 
 		 3822 aa  48.5  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1095  outer membrane autotransporter  28.97 
 
 		 10429 aa  46.6  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3927  serine/threonine protein kinase  22.99 
 
 		 1136 aa  46.6  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5361  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.63 
 
 		 2847 aa  46.2  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44134  predicted protein  32.58 
 
 		 245 aa  45.8  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5223  hemagluttinin domain-containing protein  32.24 
 
 		 2778 aa  44.3  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.224013 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>