17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0945 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0945  ATPase  100 
 
 
364 aa  746    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  26.04 
 
 
1868 aa  120  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2078  hypothetical protein  26.49 
 
 
390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1746  hypothetical protein  22.46 
 
 
373 aa  67  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000207576  normal  0.634791 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2817  ATPase  23.59 
 
 
360 aa  65.1  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0746  hypothetical protein  24.34 
 
 
396 aa  64.3  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4454  hypothetical protein  24.2 
 
 
917 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0711  hypothetical protein  25.33 
 
 
412 aa  55.8  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1584  ATPase  27.06 
 
 
356 aa  54.7  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0177  ATPase  23.83 
 
 
368 aa  53.1  0.000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.335522 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0247  hypothetical protein  23.03 
 
 
416 aa  52.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.241657  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3946  hypothetical protein  19.61 
 
 
915 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0598974  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2441  hypothetical protein  21.74 
 
 
393 aa  48.9  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.242342  normal  0.93105 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2821  ATPase  25 
 
 
474 aa  46.6  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000929757  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2791  hypothetical protein  24.07 
 
 
287 aa  46.2  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3189  hypothetical protein  24.07 
 
 
287 aa  46.2  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2667  DUF234 DEXX-box ATPase  25.85 
 
 
478 aa  43.5  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.578936 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>