18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1037 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1037  hypothetical protein  100 
 
 		 747 aa  1493    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.148112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4445  hypothetical protein  23.87 
 
 		 850 aa  168  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3946  hypothetical protein  26.28 
 
 		 915 aa  96.7  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0598974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3080  hypothetical protein  34.78 
 
 		 259 aa  90.1  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.143929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1783  hypothetical protein  23.53 
 
 		 965 aa  85.1  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.614305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5276  ATPase  23.27 
 
 		 949 aa  84.3  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.089004 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1787  hypothetical protein  24.27 
 
 		 642 aa  81.3  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.799835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4454  hypothetical protein  53.29 
 
 		 917 aa  79  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  32.73 
 
 		 3670 aa  65.1  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4718  extracellular ligand-binding receptor  23.53 
 
 		 1007 aa  65.1  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.87534 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0786  penicillin-binding protein 1C  53.42 
 
 		 1060 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.879691  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0680  penicillin-binding protein  55.07 
 
 		 942 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2555  hypothetical protein  25.68 
 
 		 2052 aa  57  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177954  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1784  hypothetical protein  22.11 
 
 		 370 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00387398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3670  cold-shock protein, DNA-binding  21.07 
 
 		 1555 aa  55.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0651926  decreased coverage  0.00853504 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40672  predicted protein  45.63 
 
 		 1034 aa  55.1  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1261  N-6 DNA methylase  24.01 
 
 		 1362 aa  50.8  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1786  hypothetical protein  21.21 
 
 		 415 aa  48.1  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00688382  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>