17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1783 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_1783  hypothetical protein  100 
 
 		 965 aa  1939    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.614305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4718  extracellular ligand-binding receptor  36.45 
 
 		 1007 aa  267  5.999999999999999e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.87534 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1786  hypothetical protein  34.29 
 
 		 415 aa  202  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00688382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1784  hypothetical protein  34.47 
 
 		 370 aa  173  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00387398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1787  hypothetical protein  31.23 
 
 		 642 aa  161  6e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.799835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1785  hypothetical protein  27.59 
 
 		 425 aa  137  8e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00000770102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1782  hypothetical protein  27.84 
 
 		 409 aa  137  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.78638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4717  hypothetical protein  28.35 
 
 		 381 aa  130  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5276  ATPase  23.79 
 
 		 949 aa  91.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.089004 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1037  hypothetical protein  23.42 
 
 		 747 aa  87.8  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.148112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4454  hypothetical protein  26.25 
 
 		 917 aa  85.5  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4445  hypothetical protein  27.86 
 
 		 850 aa  85.5  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3946  hypothetical protein  24.58 
 
 		 915 aa  81.3  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0598974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1261  N-6 DNA methylase  25.08 
 
 		 1362 aa  71.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3670  cold-shock protein, DNA-binding  24.26 
 
 		 1555 aa  60.8  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0651926  decreased coverage  0.00853504 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3080  hypothetical protein  25.82 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.143929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0128  ATPase family protein  21.26 
 
 		 463 aa  57  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000122266 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>