15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1787 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_1787  hypothetical protein  100 
 
 		 642 aa  1306    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.799835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1784  hypothetical protein  57.95 
 
 		 370 aa  382  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00387398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1786  hypothetical protein  34.87 
 
 		 415 aa  189  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00688382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4718  extracellular ligand-binding receptor  34.38 
 
 		 1007 aa  172  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.87534 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1783  hypothetical protein  31.23 
 
 		 965 aa  161  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.614305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1037  hypothetical protein  23.92 
 
 		 747 aa  85.1  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.148112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5276  ATPase  25.6 
 
 		 949 aa  67.4  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.089004 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3946  hypothetical protein  26.22 
 
 		 915 aa  67  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0598974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3080  hypothetical protein  22.67 
 
 		 259 aa  65.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.143929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4454  hypothetical protein  24.75 
 
 		 917 aa  60.5  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3670  cold-shock protein, DNA-binding  24.62 
 
 		 1555 aa  55.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0651926  decreased coverage  0.00853504 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1261  N-6 DNA methylase  24.83 
 
 		 1362 aa  53.9  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4445  hypothetical protein  22.18 
 
 		 850 aa  50.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179698  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2719  ATPase  25.69 
 
 		 420 aa  45.1  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0484066  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0386  type II secretory pathway ATPase ExeA  22.84 
 
 		 281 aa  43.9  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0184909  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>