32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3670 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3670  cold-shock protein, DNA-binding  100 
 
 		 1555 aa  3192    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0651926  decreased coverage  0.00853504 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5276  ATPase  25.18 
 
 		 949 aa  84.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.089004 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4718  extracellular ligand-binding receptor  26.33 
 
 		 1007 aa  76.3  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.87534 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1786  hypothetical protein  22.14 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00688382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3946  hypothetical protein  23.22 
 
 		 915 aa  70.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0598974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4454  hypothetical protein  22.79 
 
 		 917 aa  65.5  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1261  N-6 DNA methylase  23.19 
 
 		 1362 aa  60.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1783  hypothetical protein  24.26 
 
 		 965 aa  60.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.614305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3080  hypothetical protein  25.39 
 
 		 259 aa  58.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.143929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1037  hypothetical protein  21.07 
 
 		 747 aa  57.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.148112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1787  hypothetical protein  24.62 
 
 		 642 aa  55.8  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.799835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0786  hypothetical protein  25.25 
 
 		 2031 aa  55.5  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.635307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  23.74 
 
 		 393 aa  55.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0005  putative lipoprotein  25.24 
 
 		 271 aa  53.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  25.43 
 
 		 395 aa  52.4  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  22.34 
 
 		 833 aa  51.2  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4445  hypothetical protein  22.81 
 
 		 850 aa  50.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  27.74 
 
 		 937 aa  50.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  24.66 
 
 		 573 aa  49.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0768  TPR repeat-containing protein  24.15 
 
 		 258 aa  50.1  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.638517  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  25.14 
 
 		 405 aa  49.3  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1213  hypothetical protein  26.79 
 
 		 220 aa  49.3  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1784  hypothetical protein  23.1 
 
 		 370 aa  48.9  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00387398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  22.73 
 
 		 393 aa  48.5  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 		 399 aa  48.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1647  regulatory protein, ArsR  22.5 
 
 		 408 aa  48.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.142767  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 		 562 aa  47  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.08 
 
 		 566 aa  46.2  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3013  cold-shock DNA-binding domain protein  35.82 
 
 		 65 aa  46.2  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000213425  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  20 
 
 		 597 aa  45.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  26.06 
 
 		 935 aa  45.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  23.17 
 
 		 567 aa  45.1  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>