34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1647 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_1030  regulatory protein ArsR  92.82 
 
 		 408 aa  781    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.233858  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1147  regulatory protein ArsR  78.82 
 
 		 408 aa  690    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0948881  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1647  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 408 aa  836    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.142767  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1030  regulatory protein ArsR  98.77 
 
 		 408 aa  828    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.131336  hitchhiker  0.00297317 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0916  ArsR family transcriptional regulator  97.79 
 
 		 408 aa  821    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.658372  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0662  ATPase  30.83 
 
 		 368 aa  60.1  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0528095  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0652  general secretion pathway protein-related protein  28.93 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.116587  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0686  general secretion pathway protein-related protein  27.67 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.731417  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0687  general secretion pathway protein-related protein  27.67 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1031  AAA ATPase  27.93 
 
 		 318 aa  55.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550576  hitchhiker  0.00913297 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0285  ATPase  24.12 
 
 		 341 aa  52.8  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0697  general secretion pathway protein-related protein  27.78 
 
 		 298 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2746  ATPase  21.89 
 
 		 387 aa  50.8  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0705142  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2981  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.52 
 
 		 589 aa  50.1  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0901758 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2525  ATPase  24.17 
 
 		 334 aa  48.5  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0430753  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0561  MSHA biogenesis protein MshM  26.55 
 
 		 308 aa  48.9  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3670  cold-shock protein, DNA-binding  22.5 
 
 		 1555 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0651926  decreased coverage  0.00853504 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3115  ATPase  25 
 
 		 341 aa  47.4  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.787469  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0756  AAA ATPase  26.97 
 
 		 266 aa  47.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00453451 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0741  AAA ATPase  26.97 
 
 		 266 aa  47.4  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1725  orc1/cdc6 family replication initiation protein  23.23 
 
 		 339 aa  47  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2023  general secretion pathway protein A  28.82 
 
 		 529 aa  47.4  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142113  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0788  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.14 
 
 		 568 aa  46.6  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0884  AAA ATPase  23.12 
 
 		 318 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2310  ATPase  25.64 
 
 		 267 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3767  MSHA biogenesis protein MshM  21.78 
 
 		 302 aa  44.7  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.97 
 
 		 562 aa  45.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  37.29 
 
 		 119 aa  44.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  27.54 
 
 		 563 aa  44.3  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3404  ATPas  23.65 
 
 		 459 aa  44.3  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2401  ATPas  28.15 
 
 		 358 aa  43.5  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.471861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  30.77 
 
 		 563 aa  43.5  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0471  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.21 
 
 		 580 aa  43.1  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0462  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.21 
 
 		 577 aa  43.1  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>