39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1030 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1647  regulatory protein, ArsR  92.82 
 
 		 408 aa  781    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.142767  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0916  ArsR family transcriptional regulator  92.82 
 
 		 408 aa  781    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.658372  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1030  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 408 aa  838    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.233858  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1030  regulatory protein ArsR  93.56 
 
 		 408 aa  786    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.131336  hitchhiker  0.00297317 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1147  regulatory protein ArsR  77.45 
 
 		 408 aa  679    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0948881  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0662  ATPase  27.36 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0528095  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0285  ATPase  24.48 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0686  general secretion pathway protein-related protein  28.93 
 
 		 306 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.731417  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0687  general secretion pathway protein-related protein  28.93 
 
 		 306 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0652  general secretion pathway protein-related protein  28.3 
 
 		 305 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.116587  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0697  general secretion pathway protein-related protein  29.63 
 
 		 298 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2023  general secretion pathway protein A  28.65 
 
 		 529 aa  49.7  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142113  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1031  AAA ATPase  27.93 
 
 		 318 aa  49.3  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550576  hitchhiker  0.00913297 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3387  Type II secretory pathway  25.15 
 
 		 284 aa  48.5  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0561  MSHA biogenesis protein MshM  27.33 
 
 		 308 aa  47.8  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1725  orc1/cdc6 family replication initiation protein  22.9 
 
 		 339 aa  47.8  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2221  general secretion pathway protein-related protein  29.23 
 
 		 267 aa  47.4  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.25 
 
 		 562 aa  46.6  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3404  ATPas  27.54 
 
 		 459 aa  46.6  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2401  ATPas  28.89 
 
 		 358 aa  46.6  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.471861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3115  ATPase  24.49 
 
 		 341 aa  45.8  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.787469  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0756  AAA ATPase  28.57 
 
 		 266 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00453451 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2525  ATPase  24.46 
 
 		 334 aa  45.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0430753  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1039  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  26.77 
 
 		 680 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.978997 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0741  AAA ATPase  28.57 
 
 		 266 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1803  phage tail X family protein  24.54 
 
 		 586 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.411442 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0577  ATPase  22.01 
 
 		 387 aa  44.3  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3767  MSHA biogenesis protein MshM  22.09 
 
 		 302 aa  44.3  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2746  ATPase  21.64 
 
 		 387 aa  43.5  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0705142  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1071  AAA ATPase  22.01 
 
 		 388 aa  43.5  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.618974  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0470  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHM)  24.84 
 
 		 282 aa  43.5  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00298128  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3834  MSHA biogenesis protein MshM  27.7 
 
 		 302 aa  43.5  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.319406  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0509  MSHA biogenesis protein MshM  27.7 
 
 		 302 aa  43.5  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0506  MSHA biogenesis protein MshM  27.7 
 
 		 302 aa  43.5  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2310  ATPase  25 
 
 		 267 aa  43.5  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0485  MSHA biogenesis protein MshM  27.7 
 
 		 302 aa  43.5  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0637  ATPase  27.78 
 
 		 368 aa  43.1  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3670  cold-shock protein, DNA-binding  21.55 
 
 		 1555 aa  43.1  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0651926  decreased coverage  0.00853504 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001613  general secretion pathway protein A  25.97 
 
 		 538 aa  42.7  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>