227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1803 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1803  phage tail X family protein  100 
 
 		 586 aa  1185    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.411442 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1039  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  44.68 
 
 		 680 aa  335  2e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.978997 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1995  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  32.31 
 
 		 549 aa  253  9.000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1407  type II secretory pathway ATPase ExeA  40.46 
 
 		 430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3190  AAA ATPase  33.92 
 
 		 388 aa  134  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  33.96 
 
 		 271 aa  133  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  32.61 
 
 		 563 aa  133  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  30.75 
 
 		 563 aa  132  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0765  type II secretory pathway component ATPase  34.93 
 
 		 323 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00521912  normal  0.0426164 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1071  AAA ATPase  33.09 
 
 		 388 aa  128  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.618974  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3273  MSHA biogenesis protein MshM  36.19 
 
 		 300 aa  128  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3281  ATPase  35.94 
 
 		 303 aa  128  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.94 
 
 		 562 aa  128  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0697  general secretion pathway protein-related protein  37.2 
 
 		 298 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  26.64 
 
 		 422 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  36.03 
 
 		 549 aa  127  5e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  34 
 
 		 562 aa  124  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.92 
 
 		 613 aa  124  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  34 
 
 		 562 aa  124  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2525  ATPase  32.14 
 
 		 334 aa  124  7e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0430753  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  33.67 
 
 		 554 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1483  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.2 
 
 		 536 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  34 
 
 		 562 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.57 
 
 		 558 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.27 
 
 		 562 aa  123  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1167  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.09 
 
 		 538 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110256  hitchhiker  0.000320239 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0788  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.52 
 
 		 568 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0686  general secretion pathway protein-related protein  36.4 
 
 		 306 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.731417  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0687  general secretion pathway protein-related protein  36.4 
 
 		 306 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3505  secretion ATPase  31.2 
 
 		 831 aa  120  7e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001058 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0652  general secretion pathway protein-related protein  36.4 
 
 		 305 aa  120  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.116587  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.57 
 
 		 557 aa  120  7e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2401  ATPas  30.48 
 
 		 358 aa  119  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.471861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.83 
 
 		 587 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0177  general secretion pathway ATPase protein  27.6 
 
 		 584 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0462  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.84 
 
 		 577 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388723  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0637  ATPase  32.93 
 
 		 368 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  30.07 
 
 		 563 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0471  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.84 
 
 		 580 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2981  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.19 
 
 		 589 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0901758 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1156  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.75 
 
 		 557 aa  117  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3157  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.75 
 
 		 557 aa  117  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526164  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1233  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.75 
 
 		 557 aa  117  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.64745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3387  Type II secretory pathway  31.23 
 
 		 284 aa  117  6e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1031  AAA ATPase  32.01 
 
 		 318 aa  117  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550576  hitchhiker  0.00913297 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  32.18 
 
 		 540 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4238  ATPase  30.97 
 
 		 354 aa  116  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.614005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0561  MSHA biogenesis protein MshM  31.17 
 
 		 308 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1766  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.26 
 
 		 564 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0509  MSHA biogenesis protein MshM  31.65 
 
 		 302 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0506  MSHA biogenesis protein MshM  31.65 
 
 		 302 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1116  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.83 
 
 		 559 aa  114  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1200  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.46 
 
 		 557 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3834  MSHA biogenesis protein MshM  31.65 
 
 		 302 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.319406  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0485  MSHA biogenesis protein MshM  31.65 
 
 		 302 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0894  general secretion pathway protein, ATPase  33.21 
 
 		 275 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1085  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.56 
 
 		 541 aa  114  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0538082  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0662  ATPase  29.74 
 
 		 368 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0528095  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.54 
 
 		 572 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000460224  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3278  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  31.21 
 
 		 364 aa  113  8.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862999  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3767  MSHA biogenesis protein MshM  32.14 
 
 		 302 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00859  Type II secretory pathway, component ExeA  32.79 
 
 		 541 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1136  MSHA biogenesis protein MshM  32.58 
 
 		 296 aa  113  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0467  MSHA biogenesis protein MshM  30.56 
 
 		 309 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4111  MSHA biogenesis protein MshM  32.55 
 
 		 310 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0754  AAA ATPase  35.18 
 
 		 279 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0171  MSHA biogenesis protein MshM  29.43 
 
 		 302 aa  112  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3662  MSHA biogenesis protein MshM  30.21 
 
 		 309 aa  111  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2688  general secretion pathway protein A  31.7 
 
 		 519 aa  112  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3485  MSHA biogenesis protein MshM  32.55 
 
 		 310 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2300  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.16 
 
 		 532 aa  110  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001613  general secretion pathway protein A  29.34 
 
 		 538 aa  110  7.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0977  AAA ATPase  27.87 
 
 		 498 aa  110  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0423306  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4575  MSHA biogenesis protein MshM  32.67 
 
 		 300 aa  109  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0390  MSHA biogenesis protein MshM  31.37 
 
 		 301 aa  109  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0455  MSHA biogenesis protein MshM  33 
 
 		 300 aa  109  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2575  AAA ATPase  32.44 
 
 		 291 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0386  type II secretory pathway ATPase ExeA  34.34 
 
 		 281 aa  109  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0184909  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0205  AAA ATPase  29.68 
 
 		 302 aa  109  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1342  MSHA biogenesis protein MshM  30.1 
 
 		 307 aa  108  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.577962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3594  putative general secretion pathway protein A  30.12 
 
 		 357 aa  109  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0075  general secretion pathway protein, ATPase  29.9 
 
 		 447 aa  108  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.897971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2023  general secretion pathway protein A  33.87 
 
 		 529 aa  107  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142113  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4416  MSHA biogenesis protein MshM  30.49 
 
 		 302 aa  108  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.620402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3346  MSHA biogenesis protein MshM  31.82 
 
 		 304 aa  107  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.158291  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1638  AAA ATPase  32.08 
 
 		 291 aa  107  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00905579  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1518  AAA ATPase  29.74 
 
 		 371 aa  107  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0414498  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0285  ATPase  28.96 
 
 		 341 aa  107  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2821  MSHA biogenesis protein MshM  32.2 
 
 		 281 aa  106  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0144  AAA ATPase  29.73 
 
 		 349 aa  106  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2466  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.85 
 
 		 562 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2472  AAA ATPase  32.34 
 
 		 392 aa  105  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2310  ATPase  30.55 
 
 		 267 aa  105  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0470  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHM)  30.45 
 
 		 282 aa  104  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00298128  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1503  peptidoglycan-binding LysM  30.97 
 
 		 542 aa  104  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  29.63 
 
 		 390 aa  103  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3750  MSHA biogenesis protein MshM  31.23 
 
 		 314 aa  103  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.995764  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3056  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.57 
 
 		 536 aa  103  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0756  AAA ATPase  32.92 
 
 		 266 aa  103  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00453451 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2016  ATPase  29.7 
 
 		 338 aa  103  7e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>