184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1407 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1407  type II secretory pathway ATPase ExeA  100 
 
 		 430 aa  870    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1995  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  48.16 
 
 		 549 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1803  phage tail X family protein  40.46 
 
 		 586 aa  235  9e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.411442 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  34.16 
 
 		 563 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  32.34 
 
 		 563 aa  134  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1982  general secretion pathway protein-related protein  34.47 
 
 		 393 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3505  secretion ATPase  32.66 
 
 		 831 aa  132  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001058 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  34.77 
 
 		 549 aa  131  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1039  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  47.59 
 
 		 680 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.978997 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  37.05 
 
 		 271 aa  129  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  33.46 
 
 		 540 aa  127  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1071  AAA ATPase  33.83 
 
 		 388 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.618974  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0686  general secretion pathway protein-related protein  32.65 
 
 		 306 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.731417  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3485  MSHA biogenesis protein MshM  32.86 
 
 		 310 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3056  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.13 
 
 		 536 aa  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0509  MSHA biogenesis protein MshM  35.77 
 
 		 302 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0506  MSHA biogenesis protein MshM  35.77 
 
 		 302 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3834  MSHA biogenesis protein MshM  35.77 
 
 		 302 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.319406  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0485  MSHA biogenesis protein MshM  35.77 
 
 		 302 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4111  MSHA biogenesis protein MshM  33.2 
 
 		 310 aa  124  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3387  Type II secretory pathway  32.96 
 
 		 284 aa  123  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0687  general secretion pathway protein-related protein  32.3 
 
 		 306 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0467  MSHA biogenesis protein MshM  33.98 
 
 		 309 aa  123  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.66 
 
 		 562 aa  123  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3190  AAA ATPase  32.71 
 
 		 388 aa  123  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1217  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.6 
 
 		 536 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0697  general secretion pathway protein-related protein  32.42 
 
 		 298 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3662  MSHA biogenesis protein MshM  33.59 
 
 		 309 aa  121  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0561  MSHA biogenesis protein MshM  33.71 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.88 
 
 		 562 aa  120  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3767  MSHA biogenesis protein MshM  34.52 
 
 		 302 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  27.88 
 
 		 422 aa  120  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3273  MSHA biogenesis protein MshM  32.71 
 
 		 300 aa  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0177  general secretion pathway ATPase protein  31.06 
 
 		 584 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0652  general secretion pathway protein-related protein  34.26 
 
 		 305 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.116587  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1483  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.34 
 
 		 536 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2221  general secretion pathway protein-related protein  32.45 
 
 		 267 aa  117  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2466  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.07 
 
 		 562 aa  117  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4575  MSHA biogenesis protein MshM  30.65 
 
 		 300 aa  116  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2310  ATPase  31.09 
 
 		 267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3278  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  31.44 
 
 		 364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862999  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2472  AAA ATPase  33.33 
 
 		 392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0545  MSHA biogenesis protein MshM  35.43 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0470  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHM)  33.6 
 
 		 282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00298128  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2981  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.97 
 
 		 589 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0901758 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0686  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  34.54 
 
 		 395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539568 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3404  ATPas  29.47 
 
 		 459 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3346  MSHA biogenesis protein MshM  28.43 
 
 		 304 aa  114  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.158291  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1638  AAA ATPase  34.44 
 
 		 291 aa  113  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00905579  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0075  general secretion pathway protein, ATPase  29.55 
 
 		 447 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.897971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  30 
 
 		 558 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0756  AAA ATPase  29 
 
 		 266 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00453451 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.11 
 
 		 587 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0471  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.47 
 
 		 580 aa  112  9e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0462  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.9 
 
 		 577 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388723  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2122  AAA ATPase  32.4 
 
 		 266 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3281  ATPase  32.13 
 
 		 303 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0390  MSHA biogenesis protein MshM  32.31 
 
 		 301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  28.72 
 
 		 563 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2575  AAA ATPase  34.47 
 
 		 291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0741  AAA ATPase  28.62 
 
 		 266 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1766  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.6 
 
 		 564 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  31.7 
 
 		 390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3750  MSHA biogenesis protein MshM  32.83 
 
 		 314 aa  110  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.995764  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4416  MSHA biogenesis protein MshM  33.07 
 
 		 302 aa  111  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.620402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1085  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.34 
 
 		 541 aa  111  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0538082  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2219  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  31.84 
 
 		 395 aa  111  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0964042  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2300  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.33 
 
 		 532 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0930  sporulation domain-containing protein  29.41 
 
 		 740 aa  110  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0247822 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0765  type II secretory pathway component ATPase  33.94 
 
 		 323 aa  110  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00521912  normal  0.0426164 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.12 
 
 		 556 aa  110  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0788  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.85 
 
 		 568 aa  110  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2475  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  31.27 
 
 		 372 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3068  AAA ATPase  32.93 
 
 		 439 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224747  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1772  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  31.27 
 
 		 372 aa  109  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1518  AAA ATPase  31.2 
 
 		 371 aa  108  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0414498  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22880  General secretion pathway protein A  31.18 
 
 		 570 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499914  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0285  ATPase  30.12 
 
 		 341 aa  108  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0833  ATPase  31.3 
 
 		 387 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1303  type II secretory pathway ATPase ExeA  30.21 
 
 		 303 aa  108  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0894  general secretion pathway protein, ATPase  31.14 
 
 		 275 aa  106  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2401  ATPas  29.34 
 
 		 358 aa  106  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.471861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.38 
 
 		 572 aa  106  7e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000460224  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2827  general secretion pathway protein-related protein  32.67 
 
 		 274 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.088397  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.73 
 
 		 557 aa  105  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0662  ATPase  27.97 
 
 		 368 aa  105  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0528095  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1342  MSHA biogenesis protein MshM  31.64 
 
 		 307 aa  105  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.577962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2509  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  29.07 
 
 		 353 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.87412 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03697  Type II secretory pathway, component ExeA  31.1 
 
 		 261 aa  104  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1014  hypothetical protein  30.86 
 
 		 281 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2525  ATPase  30.12 
 
 		 334 aa  103  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0430753  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0171  MSHA biogenesis protein MshM  28.96 
 
 		 302 aa  104  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0205  AAA ATPase  28.01 
 
 		 302 aa  104  4e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1167  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.9 
 
 		 538 aa  103  7e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110256  hitchhiker  0.000320239 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0550  ATPase, Type II secretory pathway component  32.94 
 
 		 437 aa  102  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0386  type II secretory pathway ATPase ExeA  29.96 
 
 		 281 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0184909  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0144  AAA ATPase  28.63 
 
 		 349 aa  102  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00859  Type II secretory pathway, component ExeA  30.4 
 
 		 541 aa  102  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2735  general secretion pathway protein-related protein  31.87 
 
 		 274 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.052626  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.69 
 
 		 562 aa  102  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>