233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2122 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2122  AAA ATPase  100 
 
 
266 aa  541  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2221  general secretion pathway protein-related protein  67.29 
 
 
267 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0741  AAA ATPase  67.8 
 
 
266 aa  375  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0756  AAA ATPase  68.18 
 
 
266 aa  376  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00453451 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2310  ATPase  65.04 
 
 
267 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3145  AAA ATPase  62.78 
 
 
266 aa  362  4e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2919  general secretion pathway protein-related protein  46.43 
 
 
274 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00976352  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2827  general secretion pathway protein-related protein  46.03 
 
 
274 aa  218  7e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.088397  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2735  general secretion pathway protein-related protein  45.63 
 
 
274 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.052626  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1638  AAA ATPase  40.07 
 
 
291 aa  190  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00905579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2575  AAA ATPase  39.33 
 
 
291 aa  188  8e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  40.59 
 
 
271 aa  187  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1483  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.34 
 
 
536 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  37.31 
 
 
563 aa  181  9.000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  39.39 
 
 
540 aa  180  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.83 
 
 
562 aa  179  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2219  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  38.55 
 
 
395 aa  178  9e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0964042  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2466  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.32 
 
 
562 aa  177  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.81 
 
 
558 aa  177  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  37.13 
 
 
563 aa  176  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1518  AAA ATPase  38.15 
 
 
371 aa  176  3e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0414498  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2472  AAA ATPase  36.64 
 
 
392 aa  175  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3056  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.16 
 
 
536 aa  175  7e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0833  ATPase  38.55 
 
 
387 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1217  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.36 
 
 
536 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001613  general secretion pathway protein A  36.09 
 
 
538 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  35.5 
 
 
390 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2300  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.6 
 
 
532 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1085  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.78 
 
 
541 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0538082  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  38.91 
 
 
563 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.16 
 
 
562 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  38.81 
 
 
549 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3594  putative general secretion pathway protein A  35.29 
 
 
357 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.03 
 
 
572 aa  170  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000460224  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0177  general secretion pathway ATPase protein  34.57 
 
 
584 aa  169  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2688  general secretion pathway protein A  36.88 
 
 
519 aa  168  9e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2026  ATPase  35.71 
 
 
385 aa  168  9e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.328759 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0686  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  37.4 
 
 
395 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539568 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00859  Type II secretory pathway, component ExeA  33.83 
 
 
541 aa  166  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1766  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.43 
 
 
564 aa  167  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1167  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.29 
 
 
538 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110256  hitchhiker  0.000320239 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3281  ATPase  34.08 
 
 
303 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1772  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  35.11 
 
 
372 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1014  hypothetical protein  36.64 
 
 
281 aa  166  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2475  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  35.11 
 
 
372 aa  166  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2981  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.61 
 
 
589 aa  166  5e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0901758 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.17 
 
 
587 aa  166  5e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1982  general secretion pathway protein-related protein  36.64 
 
 
393 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0788  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.5 
 
 
568 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.55 
 
 
557 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.06 
 
 
613 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2509  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  34.7 
 
 
353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.87412 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2023  general secretion pathway protein A  36.43 
 
 
529 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142113  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  37.55 
 
 
554 aa  163  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02603  putative general secretion pathway protein A  36.84 
 
 
389 aa  162  4.0000000000000004e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0636367  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2401  ATPas  34.46 
 
 
358 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.471861  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3157  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.29 
 
 
557 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526164  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1156  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.29 
 
 
557 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1200  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.29 
 
 
557 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1233  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.29 
 
 
557 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.64745  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0471  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.13 
 
 
580 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.55 
 
 
562 aa  162  6e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.55 
 
 
562 aa  162  6e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.55 
 
 
562 aa  162  6e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3068  AAA ATPase  37.35 
 
 
439 aa  162  7e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224747  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0462  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.13 
 
 
577 aa  162  7e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388723  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0285  ATPase  36.36 
 
 
341 aa  161  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2582  AAA ATPase  37.93 
 
 
381 aa  160  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1116  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.55 
 
 
559 aa  160  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3278  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  35.21 
 
 
364 aa  160  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862999  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5029  putative general secretion pathway protein A  34.2 
 
 
346 aa  159  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3505  secretion ATPase  35.4 
 
 
831 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001058 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2525  ATPase  36.7 
 
 
334 aa  156  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0430753  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1071  AAA ATPase  33.46 
 
 
388 aa  156  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.618974  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22880  General secretion pathway protein A  38.58 
 
 
570 aa  155  6e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499914  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3190  AAA ATPase  32.7 
 
 
388 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3387  Type II secretory pathway  35.09 
 
 
284 aa  151  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0382  AAA ATPase  33.7 
 
 
266 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3404  ATPas  36.54 
 
 
459 aa  150  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1924  hypothetical protein  35.71 
 
 
414 aa  150  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.42704  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1329  AAA ATPase  33.7 
 
 
266 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1106  AAA ATPase  33.7 
 
 
266 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.597508  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1875  AAA ATPase  33.7 
 
 
266 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.871076  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0545  AAA ATPase  33.7 
 
 
266 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0652  general secretion pathway protein-related protein  35.36 
 
 
305 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.116587  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  32.84 
 
 
422 aa  150  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0686  general secretion pathway protein-related protein  35.36 
 
 
306 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.731417  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0687  general secretion pathway protein-related protein  35.36 
 
 
306 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0697  general secretion pathway protein-related protein  35.36 
 
 
298 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0662  ATPase  33.46 
 
 
368 aa  149  7e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0528095  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.69 
 
 
556 aa  148  7e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0561  MSHA biogenesis protein MshM  35.56 
 
 
308 aa  149  7e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  36.44 
 
 
427 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0637  ATPase  34.8 
 
 
368 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0328  AAA ATPase  35.56 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.799716  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4238  ATPase  34.98 
 
 
354 aa  147  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.614005  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3192  AAA ATPase  34.59 
 
 
266 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0103518  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2821  AAA ATPase  34.59 
 
 
266 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1711  AAA ATPase  34.59 
 
 
266 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2001  AAA ATPase  34.59 
 
 
266 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.249052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>