16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5276 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4454  hypothetical protein  51.26 
 
 		 917 aa  710    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5276  ATPase  100 
 
 		 949 aa  1928    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.089004 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3946  hypothetical protein  44.03 
 
 		 915 aa  559  1e-157  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0598974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4445  hypothetical protein  28.21 
 
 		 850 aa  118  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3080  hypothetical protein  27.31 
 
 		 259 aa  97.1  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.143929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1261  N-6 DNA methylase  28.94 
 
 		 1362 aa  91.7  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1783  hypothetical protein  23.79 
 
 		 965 aa  91.3  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.614305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1037  hypothetical protein  22.75 
 
 		 747 aa  84.7  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.148112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3670  cold-shock protein, DNA-binding  25.18 
 
 		 1555 aa  84.7  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0651926  decreased coverage  0.00853504 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4718  extracellular ligand-binding receptor  25.06 
 
 		 1007 aa  80.9  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.87534 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1786  hypothetical protein  24.94 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00688382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1784  hypothetical protein  25.13 
 
 		 370 aa  73.9  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00387398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1787  hypothetical protein  25.6 
 
 		 642 aa  67  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.799835  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20400  hypothetical protein  25.84 
 
 		 393 aa  55.5  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0177  ATPase  25.47 
 
 		 368 aa  46.2  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.335522 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1789  hypothetical protein  22.19 
 
 		 581 aa  45.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0254074 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>