15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1789 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1789  hypothetical protein  100 
 
 		 581 aa  1178    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0254074 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1954  ATPase  79.59 
 
 		 673 aa  713    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.342143  normal  0.310254 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0297  TPR repeat-containing protein  38.22 
 
 		 922 aa  259  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.276018  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0486  TPR repeat-containing protein  37.95 
 
 		 965 aa  258  2e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2442  ATPase  34.3 
 
 		 756 aa  215  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0026  hypothetical protein  30.9 
 
 		 692 aa  206  1e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.252057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0710  pentatricopeptide repeat containing protein  29.72 
 
 		 932 aa  151  3e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0248  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 		 793 aa  124  5e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.57059  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1875  TPR repeat-containing protein  28.61 
 
 		 813 aa  102  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1120  putative transcriptional regulator  27.39 
 
 		 523 aa  97.8  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4868  MarR family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 363 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.440159  normal  0.306915 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1867  MarR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 369 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4861  hypothetical protein  23.02 
 
 		 920 aa  60.5  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3564  MalT  31.01 
 
 		 695 aa  48.5  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.534347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5276  ATPase  22.45 
 
 		 949 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.089004 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>