15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1786 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_1786  hypothetical protein  100 
 
 		 415 aa  847    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00688382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1783  hypothetical protein  34.29 
 
 		 965 aa  202  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.614305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4718  extracellular ligand-binding receptor  35.48 
 
 		 1007 aa  202  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.87534 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1787  hypothetical protein  34.87 
 
 		 642 aa  189  9e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.799835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1784  hypothetical protein  32.99 
 
 		 370 aa  176  5e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00387398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4454  hypothetical protein  25.45 
 
 		 917 aa  87.4  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5276  ATPase  24.94 
 
 		 949 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.089004 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3946  hypothetical protein  27 
 
 		 915 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0598974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3670  cold-shock protein, DNA-binding  22.14 
 
 		 1555 aa  72.4  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0651926  decreased coverage  0.00853504 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0128  ATPase family protein  22.74 
 
 		 463 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000122266 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4445  hypothetical protein  23.68 
 
 		 850 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1037  hypothetical protein  21.56 
 
 		 747 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.148112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1261  N-6 DNA methylase  23.96 
 
 		 1362 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1746  hypothetical protein  22.69 
 
 		 373 aa  43.9  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000207576  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0736  ATPase  22.13 
 
 		 443 aa  43.1  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.299447  normal  0.251724 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>