26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0177 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0177  ATPase  100 
 
 
368 aa  744    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.335522 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2817  ATPase  40.82 
 
 
360 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0542  ATPase  35.51 
 
 
377 aa  194  3e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2867  ATPase  33.84 
 
 
386 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1172  ATPase  33.84 
 
 
374 aa  175  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0968898 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1746  hypothetical protein  24.53 
 
 
373 aa  90.9  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000207576  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0384  ATPase  25.59 
 
 
361 aa  80.1  0.00000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.000000176931  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0433  ATPase  26.67 
 
 
359 aa  77.8  0.0000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.520428  hitchhiker  0.00910824 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2746  ATPase  26.28 
 
 
387 aa  77  0.0000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0705142  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1933  ATPase  25.81 
 
 
356 aa  77  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0359991  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1739  ATPase  25.81 
 
 
383 aa  75.1  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1794  ATPase  25.81 
 
 
365 aa  73.6  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0171546  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2379  ATPase  26.67 
 
 
356 aa  71.2  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1584  ATPase  29.02 
 
 
356 aa  71.6  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1267  ATPase  27.63 
 
 
342 aa  68.6  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0503  ATPase  25.81 
 
 
377 aa  67  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.241974 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0150  ATPase  29.24 
 
 
360 aa  65.5  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1486  ATPase  24.46 
 
 
350 aa  63.9  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.659076  normal  0.220459 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  20.11 
 
 
1868 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2078  hypothetical protein  22.77 
 
 
390 aa  57.8  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1319  ATPase  25.82 
 
 
312 aa  56.6  0.0000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0945  ATPase  23.83 
 
 
364 aa  53.1  0.000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4454  hypothetical protein  27.4 
 
 
917 aa  46.6  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1177  ATPase  26.2 
 
 
407 aa  46.2  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0919322 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5276  ATPase  25.47 
 
 
949 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.089004 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1767  ATPase  24 
 
 
456 aa  44.3  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.53247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>