112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4718 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4718  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 1007 aa  2051    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.87534 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1783  hypothetical protein  36.09 
 
 		 965 aa  268  2.9999999999999995e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.614305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1298  Extracellular ligand-binding receptor  32.24 
 
 		 471 aa  205  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1267  Extracellular ligand-binding receptor  32.24 
 
 		 471 aa  205  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1786  hypothetical protein  35.22 
 
 		 415 aa  202  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00688382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1306  Extracellular ligand-binding receptor  33.17 
 
 		 471 aa  193  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0917  hydrophobic amino acid uptake ABC-transporter  33.61 
 
 		 529 aa  184  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0944  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  33.33 
 
 		 529 aa  183  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.910902 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1784  hypothetical protein  36.34 
 
 		 370 aa  176  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00387398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5172  Extracellular ligand-binding receptor  31.99 
 
 		 547 aa  175  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00242224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1787  hypothetical protein  34.38 
 
 		 642 aa  172  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.799835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4682  serine/threonine protein kinase  31.53 
 
 		 791 aa  164  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4967  Extracellular ligand-binding receptor  33.06 
 
 		 468 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0941  serine/threonine protein kinase  31.04 
 
 		 758 aa  157  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2131  Extracellular ligand-binding receptor  32.94 
 
 		 813 aa  155  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.651568 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2642  serine/threonine protein kinase  30.96 
 
 		 795 aa  145  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3474  serine/threonine protein kinase  30.96 
 
 		 795 aa  145  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2791  Serine/threonine protein kinase  28.86 
 
 		 780 aa  135  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0818409  normal  0.914958 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1828  extracellular ligand-binding receptor  30.66 
 
 		 512 aa  120  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2769  extracellular ligand-binding receptor  28.44 
 
 		 981 aa  119  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.394148 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4454  hypothetical protein  26.71 
 
 		 917 aa  86.3  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5276  ATPase  25.06 
 
 		 949 aa  81.3  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.089004 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3670  cold-shock protein, DNA-binding  26.33 
 
 		 1555 aa  76.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0651926  decreased coverage  0.00853504 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5073  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  27.58 
 
 		 599 aa  73.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1620  extracellular ligand-binding receptor  22.7 
 
 		 401 aa  68.9  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  0.738285 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1082  extracellular ligand-binding receptor  26.3 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2305  extracellular ligand-binding receptor  25.37 
 
 		 380 aa  67.4  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4445  hypothetical protein  24.31 
 
 		 850 aa  67  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1037  hypothetical protein  23.53 
 
 		 747 aa  66.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.148112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0341  extracellular ligand-binding receptor  22.36 
 
 		 389 aa  62  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  21.98 
 
 		 383 aa  59.7  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6474  extracellular ligand-binding receptor  24.39 
 
 		 390 aa  58.9  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0864936 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0620  extracellular ligand-binding receptor  23.33 
 
 		 398 aa  57.4  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2773  Extracellular ligand-binding receptor  22.89 
 
 		 413 aa  56.6  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3377  extracellular ligand-binding receptor  24.32 
 
 		 380 aa  56.6  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5337  Extracellular ligand-binding receptor  23.8 
 
 		 383 aa  55.1  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.958288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3150  extracellular ligand-binding receptor  23.79 
 
 		 382 aa  54.7  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3946  hypothetical protein  22.43 
 
 		 915 aa  53.9  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0598974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2037  extracellular ligand-binding receptor  22.12 
 
 		 403 aa  54.3  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.80961 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5686  Extracellular ligand-binding receptor  23.62 
 
 		 412 aa  53.9  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3080  hypothetical protein  26.23 
 
 		 259 aa  53.5  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.143929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1610  extracellular ligand-binding receptor  21.56 
 
 		 370 aa  53.5  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136446  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3401  extracellular ligand-binding receptor  24 
 
 		 381 aa  53.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.526257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1863  Extracellular ligand-binding receptor  25.24 
 
 		 814 aa  53.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.190846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1676  extracellular ligand-binding receptor  23.62 
 
 		 370 aa  52.8  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000661006  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2859  Extracellular ligand-binding receptor  23.7 
 
 		 380 aa  52.8  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191945  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2232  extracellular ligand-binding receptor  23.79 
 
 		 373 aa  52.8  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1261  N-6 DNA methylase  23.34 
 
 		 1362 aa  52.8  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0942  serine/threonine protein kinase  29.5 
 
 		 576 aa  52  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0110  Extracellular ligand-binding receptor  28.06 
 
 		 380 aa  52.4  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2648  Extracellular ligand-binding receptor  22.56 
 
 		 406 aa  52  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.401999 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2649  Extracellular ligand-binding receptor  21.86 
 
 		 386 aa  52  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000293817  normal  0.0179491 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0096  extracellular ligand-binding receptor  26.42 
 
 		 416 aa  52  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.809601 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0178  extracellular ligand-binding receptor  30.69 
 
 		 383 aa  52  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0258  amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein  25.81 
 
 		 393 aa  51.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0612  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid-binding protein  23.18 
 
 		 371 aa  50.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5315  extracellular ligand-binding receptor  20.93 
 
 		 599 aa  50.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.568135 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0937  Extracellular ligand-binding receptor  23.58 
 
 		 380 aa  50.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000952162  normal  0.230854 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1257  extracellular ligand-binding receptor  32.28 
 
 		 386 aa  50.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000744493  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4954  extracellular ligand-binding receptor  21.51 
 
 		 376 aa  50.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0182124 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6166  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 		 375 aa  50.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644445  normal  0.0557295 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6618  extracellular ligand-binding receptor  23.27 
 
 		 382 aa  50.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.868668 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6393  extracellular ligand-binding receptor  22.92 
 
 		 383 aa  49.3  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  25.21 
 
 		 381 aa  49.3  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2331  Extracellular ligand-binding receptor  28.07 
 
 		 377 aa  48.9  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6456  extracellular ligand-binding receptor  22.96 
 
 		 383 aa  48.9  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.411469  normal  0.286463 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1109  Extracellular ligand-binding receptor  35.56 
 
 		 387 aa  48.9  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0150  extracellular ligand-binding receptor  28.19 
 
 		 417 aa  48.5  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19650  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, amino acid binding protein  28.18 
 
 		 373 aa  48.5  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.337564  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.29 
 
 		 632 aa  48.5  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3052  extracellular ligand-binding receptor  20.93 
 
 		 376 aa  48.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2397  extracellular ligand-binding receptor  30.91 
 
 		 372 aa  47.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.285564  normal  0.778884 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1892  extracellular ligand-binding receptor  23.44 
 
 		 422 aa  47.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.130266  normal  0.0268601 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3862  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  24.33 
 
 		 367 aa  47.4  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03309  leucine/isoleucine/valine transporter subunit  24.06 
 
 		 367 aa  47  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2138  leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  27.63 
 
 		 371 aa  46.6  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.469771  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1761  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.08 
 
 		 467 aa  47  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2502  Extracellular ligand-binding receptor  25.24 
 
 		 400 aa  47.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3084  extracellular ligand-binding receptor  23.62 
 
 		 386 aa  46.6  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0552294  normal  0.474312 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3577  extracellular ligand-binding receptor  26.14 
 
 		 412 aa  47  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0862  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  27.63 
 
 		 371 aa  46.6  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22915  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0772  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  27.63 
 
 		 371 aa  46.6  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3659  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  24.06 
 
 		 367 aa  47  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0256  extracellular ligand-binding receptor  24.06 
 
 		 367 aa  47  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03262  hypothetical protein  24.06 
 
 		 367 aa  47  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1842  extracellular ligand-binding receptor  26.67 
 
 		 394 aa  46.2  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.843132  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3253  extracellular ligand-binding receptor  21.22 
 
 		 373 aa  46.2  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2807  putative periplasmic substrate-binding protein  22.49 
 
 		 382 aa  46.2  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0833  extracellular ligand-binding receptor  22.34 
 
 		 383 aa  46.2  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000252201  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3743  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  24.06 
 
 		 367 aa  46.2  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2606  Extracellular ligand-binding receptor  21.22 
 
 		 373 aa  46.2  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0170435  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0255  Extracellular ligand-binding receptor  24.34 
 
 		 367 aa  45.8  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3942  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  24.34 
 
 		 367 aa  45.8  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4231  Extracellular ligand-binding receptor  22.73 
 
 		 384 aa  45.8  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4780  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  24.34 
 
 		 367 aa  45.8  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0158  tetratricopeptide repeat protein  23.14 
 
 		 400 aa  45.4  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.185124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1925  extracellular ligand-binding receptor  22.74 
 
 		 377 aa  45.4  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0315464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  35.8 
 
 		 761 aa  45.4  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2841  extracellular ligand-binding receptor  20.81 
 
 		 403 aa  45.4  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1839  leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  27.15 
 
 		 371 aa  45.1  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>