14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4445 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4445  hypothetical protein  100 
 
 
850 aa  1725    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179698  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1037  hypothetical protein  24.52 
 
 
747 aa  140  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.148112  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3080  hypothetical protein  33.85 
 
 
259 aa  137  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.143929  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4454  hypothetical protein  27.52 
 
 
917 aa  134  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5276  ATPase  28.21 
 
 
949 aa  118  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.089004 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3946  hypothetical protein  28.88 
 
 
915 aa  110  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0598974  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1783  hypothetical protein  27.53 
 
 
965 aa  85.1  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.614305  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1261  N-6 DNA methylase  26.98 
 
 
1362 aa  67.4  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4718  extracellular ligand-binding receptor  24.31 
 
 
1007 aa  65.9  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.87534 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1784  hypothetical protein  22.81 
 
 
370 aa  60.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00387398  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1786  hypothetical protein  23.68 
 
 
415 aa  55.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00688382  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3670  cold-shock protein, DNA-binding  22.81 
 
 
1555 aa  50.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0651926  decreased coverage  0.00853504 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1787  hypothetical protein  22.18 
 
 
642 aa  49.3  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.799835  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2930  hypothetical protein  25.62 
 
 
1964 aa  45.1  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>