35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4454 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5276  ATPase  47.82 
 
 		 949 aa  859    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.089004 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4454  hypothetical protein  100 
 
 		 917 aa  1851    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4445  hypothetical protein  27.52 
 
 		 850 aa  136  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40672  predicted protein  44.32 
 
 		 1034 aa  105  4e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1786  hypothetical protein  25.45 
 
 		 415 aa  86.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00688382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4718  extracellular ligand-binding receptor  26.71 
 
 		 1007 aa  85.9  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.87534 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1783  hypothetical protein  27.24 
 
 		 965 aa  84.7  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.614305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3080  hypothetical protein  25.83 
 
 		 259 aa  84.3  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.143929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2382  TRD5  38.1 
 
 		 253 aa  80.5  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3946  hypothetical protein  41.9 
 
 		 915 aa  79.7  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0598974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1784  hypothetical protein  25.39 
 
 		 370 aa  77  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00387398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1261  N-6 DNA methylase  27.43 
 
 		 1362 aa  73.9  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37425  predicted protein  47.68 
 
 		 1569 aa  70.9  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.61446  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  40.91 
 
 		 3670 aa  69.7  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1037  hypothetical protein  20.63 
 
 		 747 aa  67.4  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.148112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3670  cold-shock protein, DNA-binding  23.11 
 
 		 1555 aa  63.9  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0651926  decreased coverage  0.00853504 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0945  ATPase  24.2 
 
 		 364 aa  62  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5025  hypothetical protein  31.14 
 
 		 481 aa  59.7  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.898737  normal  0.21169 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1787  hypothetical protein  24.82 
 
 		 642 aa  58.9  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.799835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0786  penicillin-binding protein 1C  48.75 
 
 		 1060 aa  58.2  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.879691  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0680  penicillin-binding protein  50.68 
 
 		 942 aa  58.2  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11472  predicted protein  42.31 
 
 		 344 aa  57  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.408612  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2482  hypothetical protein  42.55 
 
 		 171 aa  53.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67464  Ca2+-modulated nonselective cation channel polycystin  26.25 
 
 		 969 aa  51.2  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0786  hypothetical protein  20.08 
 
 		 2031 aa  49.7  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.635307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28282  predicted protein  29.41 
 
 		 3288 aa  48.5  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2817  ATPase  24.05 
 
 		 360 aa  47.8  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2555  hypothetical protein  23.23 
 
 		 2052 aa  47  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177954  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2160  hypothetical protein  50 
 
 		 57 aa  46.6  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.101266 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0177  ATPase  27.4 
 
 		 368 aa  46.2  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.335522 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1172  ATPase  23.11 
 
 		 374 aa  45.8  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0968898 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0855  hypothetical protein  29.27 
 
 		 1829 aa  45.8  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.890164  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3231  hypothetical protein  23.4 
 
 		 382 aa  45.4  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3232  hypothetical protein  23.4 
 
 		 382 aa  45.4  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2867  ATPase  28.48 
 
 		 386 aa  45.1  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>