20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_11472 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_11472  predicted protein  100 
 
 		 344 aa  582  1.0000000000000001e-165  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.408612  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40672  predicted protein  46.86 
 
 		 1034 aa  195  8.000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13439  predicted protein  41.93 
 
 		 347 aa  139  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199719  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37425  predicted protein  40.4 
 
 		 1569 aa  137  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.61446  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2382  TRD5  43.37 
 
 		 253 aa  125  8.000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15060  predicted protein  41.41 
 
 		 191 aa  81.6  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44134  predicted protein  37.88 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_1800  predicted protein  37.11 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1839  copper resistance B precursor  31.43 
 
 		 429 aa  67  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.425584  hitchhiker  0.0000315743 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5101  copper resistance B precursor  31.75 
 
 		 421 aa  66.2  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.082477 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48553  predicted protein  41.92 
 
 		 952 aa  64.3  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.102709  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6113  Cu(II)/Cu(I) resistance outer membrane protein CopB  24.47 
 
 		 495 aa  64.3  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.109399  normal  0.679723 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34245  predicted protein  39.71 
 
 		 164 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0191281  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38100  predicted protein  49.23 
 
 		 133 aa  55.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3687  hypothetical protein  30.43 
 
 		 473 aa  53.5  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0786  penicillin-binding protein 1C  35.71 
 
 		 1060 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.879691  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0680  penicillin-binding protein  35.71 
 
 		 942 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  22.48 
 
 		 741 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3232  hypothetical protein  30.71 
 
 		 382 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3231  hypothetical protein  32.65 
 
 		 382 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>