17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_13439 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011679  PHATR_13439  predicted protein  100 
 
 		 347 aa  608  1e-173  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199719  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40672  predicted protein  41.94 
 
 		 1034 aa  176  4e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44134  predicted protein  45.98 
 
 		 245 aa  139  8.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11472  predicted protein  40.52 
 
 		 344 aa  134  3e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.408612  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2382  TRD5  39.76 
 
 		 253 aa  109  6e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37425  predicted protein  36.42 
 
 		 1569 aa  104  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.61446  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15060  predicted protein  43.52 
 
 		 191 aa  99  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6113  Cu(II)/Cu(I) resistance outer membrane protein CopB  27.97 
 
 		 495 aa  81.6  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.109399  normal  0.679723 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1839  copper resistance B precursor  35 
 
 		 429 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.425584  hitchhiker  0.0000315743 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48553  predicted protein  37.17 
 
 		 952 aa  72.8  0.000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.102709  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5101  copper resistance B precursor  35.11 
 
 		 421 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.082477 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34245  predicted protein  40.59 
 
 		 164 aa  58.9  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0191281  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38100  predicted protein  47.95 
 
 		 133 aa  48.5  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_1800  predicted protein  34.66 
 
 		 284 aa  46.6  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_40475  predicted protein  45.57 
 
 		 130 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.802438  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50095  predicted protein  34.35 
 
 		 982 aa  43.5  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  32.03 
 
 		 3670 aa  43.1  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>