17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_44134 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011671  PHATR_44134  predicted protein  100 
 
 
245 aa  435  1e-121  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13439  predicted protein  45.98 
 
 
347 aa  139  4.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199719  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40672  predicted protein  37.96 
 
 
1034 aa  124  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2382  TRD5  40.55 
 
 
253 aa  101  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6113  Cu(II)/Cu(I) resistance outer membrane protein CopB  23.2 
 
 
495 aa  84  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.109399  normal  0.679723 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15060  predicted protein  41.46 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1839  copper resistance B precursor  29.71 
 
 
429 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.425584  hitchhiker  0.0000315743 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5101  copper resistance B precursor  29.37 
 
 
421 aa  68.6  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.082477 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11472  predicted protein  34.48 
 
 
344 aa  68.6  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.408612  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34245  predicted protein  41.82 
 
 
164 aa  57.8  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0191281  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37425  predicted protein  31.67 
 
 
1569 aa  57.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.61446  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50095  predicted protein  37.35 
 
 
982 aa  51.6  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38100  predicted protein  44.68 
 
 
133 aa  50.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_40475  predicted protein  32.28 
 
 
130 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.802438  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48553  predicted protein  38.68 
 
 
952 aa  43.9  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.102709  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0954  hypothetical protein  33.87 
 
 
82 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.167212  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0903  Chromosome segregation ATPase-like protein  39.29 
 
 
1022 aa  42  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>