112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6113 on replicon NC_007971
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007971  Rmet_6113  Cu(II)/Cu(I) resistance outer membrane protein CopB  100 
 
 		 495 aa  999    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.109399  normal  0.679723 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1839  copper resistance B precursor  76.38 
 
 		 429 aa  624  1e-177  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.425584  hitchhiker  0.0000315743 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5101  copper resistance B precursor  76.64 
 
 		 421 aa  606  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.082477 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5670  copper resistance protein B  76.35 
 
 		 360 aa  472  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.366564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1778  copper resistance B precursor  74.82 
 
 		 332 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104151  normal  0.145157 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0657  copper resistance protein B  70.89 
 
 		 346 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5337  copper resistance B precursor  72.22 
 
 		 324 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1720  copper resistance B precursor  72.59 
 
 		 324 aa  431  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.099384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2488  copper resistance B precursor  73.02 
 
 		 337 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519855  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2339  copper resistance B precursor  67.95 
 
 		 343 aa  355  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1234  copper resistance B precursor  64.86 
 
 		 326 aa  347  3e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0449  copper resistance B precursor  64.48 
 
 		 326 aa  345  1e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.835872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1325  copper resistance protein B  58.74 
 
 		 288 aa  314  2.9999999999999996e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.282385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3256  copper resistance B precursor  51.59 
 
 		 318 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.27948  normal  0.22863 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2217  copper resistance B precursor  48.41 
 
 		 363 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0429936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0013  copper resistance B precursor  46.13 
 
 		 371 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.001908  normal  0.0882664 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0015  copper resistance B precursor  46.13 
 
 		 371 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0966383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0013  copper resistance B precursor  46.13 
 
 		 371 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.188743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1946  putative copper resistance protein B  49.82 
 
 		 287 aa  280  5e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.300672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3232  copper resistance protein B  43.48 
 
 		 397 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.197761  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37810  copper resistance protein B precursor  45.73 
 
 		 351 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0815776  normal  0.208347 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5182  copper resistance B precursor  43.98 
 
 		 371 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.336515  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5379  copper resistance B precursor  47.09 
 
 		 369 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.486591 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1494  copper resistance B precursor  47.8 
 
 		 312 aa  262  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.196943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3811  copper resistance B precursor  44.86 
 
 		 301 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.992888  normal  0.848683 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0573  copper resistance B precursor  44.52 
 
 		 311 aa  236  7e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.972949 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1267  copper resistance B precursor  48.16 
 
 		 303 aa  231  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00955945  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3106  copper resistance B precursor  42.35 
 
 		 341 aa  230  5e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1712  copper resistance B precursor  45.45 
 
 		 288 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.322874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0273  copper resistance B precursor  48.84 
 
 		 274 aa  218  2e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.500422  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3545  copper resistance B precursor  49.06 
 
 		 237 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0320075  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3915  copper resistance protein B  42.21 
 
 		 258 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1970  copper resistance B precursor  46.23 
 
 		 237 aa  207  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4288  copper resistance B precursor  46.23 
 
 		 237 aa  207  5e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.28688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0250  copper resistance B precursor  46.23 
 
 		 237 aa  207  5e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1570  copper resistance B precursor  40.59 
 
 		 302 aa  205  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.729928  normal  0.0120943 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5375  copper resistance B precursor  45.07 
 
 		 306 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.357667 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03131  copper resistance protein B  37.12 
 
 		 368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2930  copper resistance B precursor  36.95 
 
 		 347 aa  200  5e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1482  copper resistance B precursor  45.54 
 
 		 272 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000648661 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00270  Copper resistance B precursor  39.72 
 
 		 323 aa  196  7e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3415  copper resistance B precursor  46.01 
 
 		 298 aa  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1827  copper resistance B precursor  36.91 
 
 		 291 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.193991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0202  copper resistance B precursor  47.06 
 
 		 260 aa  187  4e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2457  copper resistance B precursor  40.65 
 
 		 323 aa  184  3e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379097  normal  0.733317 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2204  copper resistance protein B, putative  43.66 
 
 		 294 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2220  copper resistance B precursor  39.13 
 
 		 341 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.205984  normal  0.780487 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2421  copper resistance B precursor  33.42 
 
 		 403 aa  177  4e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2351  copper resistance B precursor  40.67 
 
 		 398 aa  174  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0696  putative copper-resistance protein CopB  37.34 
 
 		 384 aa  173  6.999999999999999e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000706782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4396  copper resistance B precursor  40.35 
 
 		 256 aa  172  9e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.523353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1376  copper resistance B precursor  40.83 
 
 		 247 aa  172  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.379919  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0711  copper resistance B precursor  35.64 
 
 		 354 aa  172  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136599 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5380  copper resistance protein A  72 
 
 		 669 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.537951 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2205  copper resistance B precursor  44.34 
 
 		 262 aa  167  5e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2135  copper resistance B precursor  34.05 
 
 		 351 aa  163  6e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0381  copper resistance B precursor  38.46 
 
 		 353 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0189  putative copper resistance protein CopB precursor  38.03 
 
 		 260 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2115  copper resistance B precursor  40.76 
 
 		 235 aa  160  5e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1708  copper resistance B precursor  39.71 
 
 		 237 aa  159  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00160337  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1574  copper resistance B precursor  40.76 
 
 		 235 aa  159  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0785  copper resistance B precursor  40.38 
 
 		 321 aa  157  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.969863  normal  0.401852 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0015  CopA family copper resistance protein  64.49 
 
 		 671 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.156592  normal  0.0651456 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0017  CopA family copper resistance protein  64.49 
 
 		 652 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0816359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0015  CopA family copper resistance protein  64.49 
 
 		 652 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4266  copper resistance B precursor  42.52 
 
 		 249 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.852956  decreased coverage  0.00992965 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2630  copper resistance B precursor  36.11 
 
 		 313 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.879879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0093  copper resistance B precursor  35.49 
 
 		 314 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0347  copper resistance B precursor  39.23 
 
 		 236 aa  149  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515255 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3622  copper resistance B precursor  36.87 
 
 		 305 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2491  copper resistance B precursor  36.87 
 
 		 305 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0109  copper resistance protein B precursor  38.86 
 
 		 289 aa  145  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00404  hypothetical protein  37.56 
 
 		 235 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0721  hypothetical protein  36.46 
 
 		 420 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.353203  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0127  copper resistance B precursor  35.79 
 
 		 246 aa  114  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1590  copper-resistance protein CopB  31.08 
 
 		 339 aa  108  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000266353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0574  CopA family copper resistance protein  62.22 
 
 		 619 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0734  hypothetical protein  24.04 
 
 		 1821 aa  94.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3546  copper-resistance protein CopA  69.62 
 
 		 664 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0666183  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44134  predicted protein  23.2 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5180  CopA family copper resistance protein  53.06 
 
 		 605 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13439  predicted protein  27.97 
 
 		 347 aa  81.6  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199719  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0249  CopA family copper resistance protein  65.48 
 
 		 672 aa  79  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1969  copper-resistance protein, CopA family protein  53.21 
 
 		 657 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0736  hypothetical protein  22.78 
 
 		 1543 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.487887  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00841  hypothetical protein  20.83 
 
 		 1584 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6893  multicopper oxidase type 3  37.17 
 
 		 941 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.845063 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2219  CopA family copper resistance protein  66.04 
 
 		 604 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00411811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2338  CopA family copper resistance protein  60.61 
 
 		 626 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6647  multicopper oxidase type 3  33.52 
 
 		 946 aa  57.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0481943  normal  0.204114 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5181  hypothetical protein  44 
 
 		 107 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.385313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0014  hypothetical protein  52.46 
 
 		 113 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00739134  normal  0.0662412 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0016  hypothetical protein  70 
 
 		 107 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.157597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0014  hypothetical protein  52.46 
 
 		 113 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.204027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37425  predicted protein  21.81 
 
 		 1569 aa  55.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.61446  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11472  predicted protein  22.43 
 
 		 344 aa  54.7  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.408612  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40672  predicted protein  21.35 
 
 		 1034 aa  54.3  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3231  copper resistance protein A precursor  43.82 
 
 		 607 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2205  CopA family copper resistance protein  43.06 
 
 		 574 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0126  CopA family copper resistance protein  40.91 
 
 		 569 aa  50.8  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>