24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_15060 on replicon NC_011685
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011685  PHATRDRAFT_15060  predicted protein  100 
 
 
191 aa  311  3.9999999999999997e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40672  predicted protein  44.33 
 
 
1034 aa  122  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2382  TRD5  40.39 
 
 
253 aa  100  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13439  predicted protein  43.52 
 
 
347 aa  99  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199719  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44134  predicted protein  41.55 
 
 
245 aa  79.7  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11472  predicted protein  36.27 
 
 
344 aa  68.6  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.408612  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37425  predicted protein  32.26 
 
 
1569 aa  58.5  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.61446  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3644  hypothetical protein  31.11 
 
 
165 aa  53.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1839  copper resistance B precursor  26.72 
 
 
429 aa  48.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.425584  hitchhiker  0.0000315743 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34245  predicted protein  42.86 
 
 
164 aa  48.1  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0191281  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48553  predicted protein  37.43 
 
 
952 aa  47.4  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.102709  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  30.3 
 
 
3670 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5077  hypothetical protein  42.62 
 
 
325 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4715  hypothetical protein  42.62 
 
 
331 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5101  copper resistance B precursor  25.19 
 
 
421 aa  45.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.082477 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0954  hypothetical protein  40 
 
 
82 aa  45.4  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.167212  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0597  hypothetical protein  52.38 
 
 
330 aa  44.3  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.946017  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5025  hypothetical protein  24.84 
 
 
481 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.898737  normal  0.21169 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4940  hypothetical protein  52.38 
 
 
327 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4928  hypothetical protein  26.13 
 
 
315 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.443955 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0820  hypothetical protein  47.17 
 
 
334 aa  43.1  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1611  hypothetical protein  40.68 
 
 
318 aa  42.7  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.5466e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1178  hypothetical protein  48.65 
 
 
314 aa  41.2  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0252  flagellar assembly protein H  34.33 
 
 
236 aa  41.2  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>