16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_1800 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_1800  predicted protein  100 
 
 
284 aa  412  1e-114  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37425  predicted protein  50.75 
 
 
1569 aa  130  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.61446  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3687  hypothetical protein  34.88 
 
 
473 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11472  predicted protein  42.86 
 
 
344 aa  93.6  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.408612  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2382  TRD5  40.42 
 
 
253 aa  68.2  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40672  predicted protein  44.53 
 
 
1034 aa  67.4  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13439  predicted protein  34.67 
 
 
347 aa  67  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199719  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48553  predicted protein  41.53 
 
 
952 aa  66.2  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.102709  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0786  penicillin-binding protein 1C  37.68 
 
 
1060 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.879691  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0680  penicillin-binding protein  35.62 
 
 
942 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2482  hypothetical protein  35.71 
 
 
171 aa  47.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2837  hypothetical protein  32.97 
 
 
1149 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00137938  hitchhiker  0.00529506 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4223  hypothetical protein  33.33 
 
 
208 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.596689 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2743  hypothetical protein  33.33 
 
 
1147 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000711361  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2760  hypothetical protein  33.33 
 
 
1143 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000120005  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1616  hypothetical protein  34 
 
 
1148 aa  42.7  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000783547  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>