114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5101 on replicon NC_012849
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012849  Rpic12D_5101  copper resistance B precursor  100 
 
 		 421 aa  855    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.082477 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1839  copper resistance B precursor  92.77 
 
 		 429 aa  799    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.425584  hitchhiker  0.0000315743 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6113  Cu(II)/Cu(I) resistance outer membrane protein CopB  76.64 
 
 		 495 aa  606  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.109399  normal  0.679723 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1778  copper resistance B precursor  79.86 
 
 		 332 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104151  normal  0.145157 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1720  copper resistance B precursor  78.81 
 
 		 324 aa  455  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.099384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5670  copper resistance protein B  73.65 
 
 		 360 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.366564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5337  copper resistance B precursor  78.44 
 
 		 324 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931181  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0657  copper resistance protein B  71.43 
 
 		 346 aa  449  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2488  copper resistance B precursor  69.06 
 
 		 337 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519855  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2339  copper resistance B precursor  64.48 
 
 		 343 aa  344  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1234  copper resistance B precursor  62.16 
 
 		 326 aa  338  8e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0449  copper resistance B precursor  62.16 
 
 		 326 aa  338  9.999999999999999e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.835872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1325  copper resistance protein B  57.99 
 
 		 288 aa  317  2e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.282385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3256  copper resistance B precursor  53.36 
 
 		 318 aa  298  1e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.27948  normal  0.22863 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1946  putative copper resistance protein B  50.19 
 
 		 287 aa  276  5e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.300672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3232  copper resistance protein B  41.28 
 
 		 397 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.197761  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0013  copper resistance B precursor  39.18 
 
 		 371 aa  255  9e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.001908  normal  0.0882664 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0015  copper resistance B precursor  39.18 
 
 		 371 aa  255  9e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0966383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0013  copper resistance B precursor  39.18 
 
 		 371 aa  255  9e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.188743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37810  copper resistance protein B precursor  43.57 
 
 		 351 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0815776  normal  0.208347 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1267  copper resistance B precursor  51.23 
 
 		 303 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00955945  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2217  copper resistance B precursor  42.09 
 
 		 363 aa  243  6e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0429936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5182  copper resistance B precursor  40.32 
 
 		 371 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.336515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1494  copper resistance B precursor  44.29 
 
 		 312 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.196943  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5379  copper resistance B precursor  41.33 
 
 		 369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.486591 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0573  copper resistance B precursor  42.41 
 
 		 311 aa  225  9e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.972949 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3811  copper resistance B precursor  41.33 
 
 		 301 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.992888  normal  0.848683 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5375  copper resistance B precursor  42.18 
 
 		 306 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.357667 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0273  copper resistance B precursor  50.49 
 
 		 274 aa  210  4e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.500422  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1482  copper resistance B precursor  48.36 
 
 		 272 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000648661 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1712  copper resistance B precursor  47.57 
 
 		 288 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.322874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3545  copper resistance B precursor  47.17 
 
 		 237 aa  204  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0320075  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1970  copper resistance B precursor  47.39 
 
 		 237 aa  204  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4288  copper resistance B precursor  47.39 
 
 		 237 aa  204  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.28688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0250  copper resistance B precursor  47.39 
 
 		 237 aa  204  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3106  copper resistance B precursor  36.92 
 
 		 341 aa  200  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37471  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3915  copper resistance protein B  41.06 
 
 		 258 aa  199  9e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1570  copper resistance B precursor  45.1 
 
 		 302 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.729928  normal  0.0120943 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03131  copper resistance protein B  35.28 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2457  copper resistance B precursor  43.27 
 
 		 323 aa  194  3e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379097  normal  0.733317 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3415  copper resistance B precursor  44.25 
 
 		 298 aa  192  7e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0202  copper resistance B precursor  48.04 
 
 		 260 aa  192  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00270  Copper resistance B precursor  38.26 
 
 		 323 aa  187  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2930  copper resistance B precursor  35.12 
 
 		 347 aa  185  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1827  copper resistance B precursor  44.39 
 
 		 291 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.193991  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2204  copper resistance protein B, putative  44.88 
 
 		 294 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2205  copper resistance B precursor  47.06 
 
 		 262 aa  179  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2351  copper resistance B precursor  41.71 
 
 		 398 aa  170  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2421  copper resistance B precursor  33.07 
 
 		 403 aa  169  6e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2220  copper resistance B precursor  42.78 
 
 		 341 aa  169  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.205984  normal  0.780487 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1708  copper resistance B precursor  41.51 
 
 		 237 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00160337  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0711  copper resistance B precursor  34.25 
 
 		 354 aa  161  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136599 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1574  copper resistance B precursor  44.92 
 
 		 235 aa  160  4e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0381  copper resistance B precursor  37.16 
 
 		 353 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2115  copper resistance B precursor  44.39 
 
 		 235 aa  159  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0189  putative copper resistance protein CopB precursor  40.28 
 
 		 260 aa  158  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2135  copper resistance B precursor  39.13 
 
 		 351 aa  157  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2630  copper resistance B precursor  38.61 
 
 		 313 aa  157  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.879879  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5380  copper resistance protein A  58.45 
 
 		 669 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.537951 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0015  CopA family copper resistance protein  55.48 
 
 		 671 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.156592  normal  0.0651456 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0017  CopA family copper resistance protein  55.48 
 
 		 652 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0816359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0015  CopA family copper resistance protein  55.48 
 
 		 652 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0785  copper resistance B precursor  36.12 
 
 		 321 aa  150  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.969863  normal  0.401852 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1376  copper resistance B precursor  37.85 
 
 		 247 aa  150  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.379919  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2491  copper resistance B precursor  36.87 
 
 		 305 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0696  putative copper-resistance protein CopB  34.11 
 
 		 384 aa  149  8e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000706782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3622  copper resistance B precursor  36.41 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4396  copper resistance B precursor  36.06 
 
 		 256 aa  149  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.523353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4266  copper resistance B precursor  42.23 
 
 		 249 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.852956  decreased coverage  0.00992965 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00404  hypothetical protein  36.15 
 
 		 235 aa  143  5e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0093  copper resistance B precursor  38.92 
 
 		 314 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0109  copper resistance protein B precursor  38.42 
 
 		 289 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0347  copper resistance B precursor  32.49 
 
 		 236 aa  136  8e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515255 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0721  hypothetical protein  41.45 
 
 		 420 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.353203  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0127  copper resistance B precursor  36.36 
 
 		 246 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1590  copper-resistance protein CopB  31.47 
 
 		 339 aa  108  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000266353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0574  CopA family copper resistance protein  67.65 
 
 		 619 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5180  CopA family copper resistance protein  58.02 
 
 		 605 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2219  CopA family copper resistance protein  59.42 
 
 		 604 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00411811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13439  predicted protein  35.11 
 
 		 347 aa  72.4  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199719  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2338  CopA family copper resistance protein  68.25 
 
 		 626 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44134  predicted protein  29.37 
 
 		 245 aa  68.6  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11472  predicted protein  31.75 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.408612  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0014  hypothetical protein  45.45 
 
 		 113 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00739134  normal  0.0662412 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0014  hypothetical protein  45.45 
 
 		 113 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.204027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0016  hypothetical protein  45.45 
 
 		 107 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.157597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3546  copper-resistance protein CopA  51.72 
 
 		 664 aa  62.8  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0666183  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5181  hypothetical protein  46.59 
 
 		 107 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.385313  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2345  hypothetical protein  22.27 
 
 		 1064 aa  56.2  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0734  hypothetical protein  24.32 
 
 		 1821 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0249  CopA family copper resistance protein  49.38 
 
 		 672 aa  55.1  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1713  CopA family copper resistance protein  52.94 
 
 		 580 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0800  copper resistance protein B  23.7 
 
 		 803 aa  53.9  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37425  predicted protein  29.37 
 
 		 1569 aa  53.5  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.61446  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40672  predicted protein  28.15 
 
 		 1034 aa  53.1  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3999  multicopper oxidase  56.6 
 
 		 539 aa  53.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2205  CopA family copper resistance protein  43.06 
 
 		 574 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6893  multicopper oxidase type 3  33.95 
 
 		 941 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.845063 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0126  CopA family copper resistance protein  57.78 
 
 		 569 aa  52.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34245  predicted protein  25.93 
 
 		 164 aa  50.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0191281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>