74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0381 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0381  copper resistance B precursor  100 
 
 
353 aa  709    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2491  copper resistance B precursor  55.21 
 
 
305 aa  338  7e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3622  copper resistance B precursor  54.37 
 
 
305 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1376  copper resistance B precursor  46.3 
 
 
247 aa  202  8e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.379919  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2930  copper resistance B precursor  48.1 
 
 
347 aa  197  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0785  copper resistance B precursor  49.26 
 
 
321 aa  196  5.000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.969863  normal  0.401852 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4266  copper resistance B precursor  47.73 
 
 
249 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.852956  decreased coverage  0.00992965 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0013  copper resistance B precursor  45.87 
 
 
371 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.188743  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0015  copper resistance B precursor  45.87 
 
 
371 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0966383  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4396  copper resistance B precursor  40.99 
 
 
256 aa  192  7e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.523353  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0013  copper resistance B precursor  45.87 
 
 
371 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.001908  normal  0.0882664 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5182  copper resistance B precursor  44.04 
 
 
371 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.336515  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2217  copper resistance B precursor  44.55 
 
 
363 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0429936  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3415  copper resistance B precursor  43.58 
 
 
298 aa  190  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3232  copper resistance protein B  44.5 
 
 
397 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.197761  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0202  copper resistance B precursor  43.4 
 
 
260 aa  187  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2421  copper resistance B precursor  46.76 
 
 
403 aa  187  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2135  copper resistance B precursor  43.81 
 
 
351 aa  187  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37810  copper resistance protein B precursor  43.58 
 
 
351 aa  186  7e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0815776  normal  0.208347 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0573  copper resistance B precursor  41.74 
 
 
311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.972949 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5379  copper resistance B precursor  43.12 
 
 
369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.486591 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1712  copper resistance B precursor  43.12 
 
 
288 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.322874  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3545  copper resistance B precursor  49.2 
 
 
237 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0320075  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1325  copper resistance protein B  42.2 
 
 
288 aa  181  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.282385  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1494  copper resistance B precursor  42.2 
 
 
312 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.196943  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3811  copper resistance B precursor  40.83 
 
 
301 aa  179  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.992888  normal  0.848683 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1482  copper resistance B precursor  40.91 
 
 
272 aa  180  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000648661 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5375  copper resistance B precursor  40.37 
 
 
306 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.357667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2220  copper resistance B precursor  44.61 
 
 
341 aa  178  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.205984  normal  0.780487 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0657  copper resistance protein B  42.66 
 
 
346 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2351  copper resistance B precursor  42.86 
 
 
398 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3106  copper resistance B precursor  42.38 
 
 
341 aa  177  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37471  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1970  copper resistance B precursor  48.13 
 
 
237 aa  177  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0250  copper resistance B precursor  48.13 
 
 
237 aa  177  4e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4288  copper resistance B precursor  48.13 
 
 
237 aa  177  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.28688  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0189  putative copper resistance protein CopB precursor  42.93 
 
 
260 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2339  copper resistance B precursor  41.36 
 
 
343 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254235  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2630  copper resistance B precursor  40.1 
 
 
313 aa  172  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.879879  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3256  copper resistance B precursor  40.37 
 
 
318 aa  170  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.27948  normal  0.22863 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00270  Copper resistance B precursor  42.38 
 
 
323 aa  169  9e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00404  hypothetical protein  41.56 
 
 
235 aa  166  5e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2115  copper resistance B precursor  39.23 
 
 
235 aa  164  3e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1570  copper resistance B precursor  39.45 
 
 
302 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.729928  normal  0.0120943 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6113  Cu(II)/Cu(I) resistance outer membrane protein CopB  38.46 
 
 
495 aa  162  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.109399  normal  0.679723 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1574  copper resistance B precursor  38.65 
 
 
235 aa  162  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1827  copper resistance B precursor  38.53 
 
 
291 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.193991  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0347  copper resistance B precursor  44.5 
 
 
236 aa  160  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.515255 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5670  copper resistance protein B  37.61 
 
 
360 aa  159  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.366564  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1708  copper resistance B precursor  38.57 
 
 
237 aa  159  6e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00160337  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2488  copper resistance B precursor  39.45 
 
 
337 aa  159  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519855  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5337  copper resistance B precursor  37.16 
 
 
324 aa  159  8e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931181  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1720  copper resistance B precursor  37.16 
 
 
324 aa  159  8e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.099384  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5101  copper resistance B precursor  37.16 
 
 
421 aa  159  9e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.082477 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1778  copper resistance B precursor  37.61 
 
 
332 aa  159  9e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104151  normal  0.145157 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1839  copper resistance B precursor  37.16 
 
 
429 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.425584  hitchhiker  0.0000315743 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1946  putative copper resistance protein B  36.7 
 
 
287 aa  157  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.300672  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2204  copper resistance protein B, putative  37.79 
 
 
294 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3915  copper resistance protein B  37.61 
 
 
258 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0273  copper resistance B precursor  37.8 
 
 
274 aa  152  8e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.500422  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1267  copper resistance B precursor  36.36 
 
 
303 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00955945  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03131  copper resistance protein B  38.28 
 
 
368 aa  152  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2205  copper resistance B precursor  36.99 
 
 
262 aa  151  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1234  copper resistance B precursor  35.62 
 
 
326 aa  147  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0449  copper resistance B precursor  34.25 
 
 
326 aa  143  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.835872  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0109  copper resistance protein B precursor  36.32 
 
 
289 aa  133  5e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0093  copper resistance B precursor  36.79 
 
 
314 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0127  copper resistance B precursor  38.14 
 
 
246 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2457  copper resistance B precursor  32.85 
 
 
323 aa  127  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379097  normal  0.733317 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0711  copper resistance B precursor  25.27 
 
 
354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.136599 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0696  putative copper-resistance protein CopB  29.03 
 
 
384 aa  99  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000706782  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1590  copper-resistance protein CopB  28.63 
 
 
339 aa  96.3  7e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000266353  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2931  hypothetical protein  26.19 
 
 
232 aa  63.5  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.771222  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0800  copper resistance protein B  22.46 
 
 
803 aa  45.4  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2345  hypothetical protein  24.61 
 
 
1064 aa  42.7  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>