151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0696 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0696  putative copper-resistance protein CopB  100 
 
 
384 aa  765    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000706782  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0711  copper resistance B precursor  75.32 
 
 
354 aa  559  1e-158  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.136599 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6113  Cu(II)/Cu(I) resistance outer membrane protein CopB  39.21 
 
 
495 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.109399  normal  0.679723 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1839  copper resistance B precursor  36.34 
 
 
429 aa  171  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.425584  hitchhiker  0.0000315743 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5101  copper resistance B precursor  34.17 
 
 
421 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.082477 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1778  copper resistance B precursor  35.59 
 
 
332 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104151  normal  0.145157 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1946  putative copper resistance protein B  34.33 
 
 
287 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.300672  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0657  copper resistance protein B  35.14 
 
 
346 aa  139  8.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1720  copper resistance B precursor  35.09 
 
 
324 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.099384  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0013  copper resistance B precursor  32.04 
 
 
371 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.001908  normal  0.0882664 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0015  copper resistance B precursor  32.04 
 
 
371 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0966383  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0013  copper resistance B precursor  32.04 
 
 
371 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.188743  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1325  copper resistance protein B  36.74 
 
 
288 aa  135  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.282385  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5337  copper resistance B precursor  34.74 
 
 
324 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931181  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3256  copper resistance B precursor  34.8 
 
 
318 aa  134  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.27948  normal  0.22863 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3106  copper resistance B precursor  31.47 
 
 
341 aa  133  5e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37471  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1234  copper resistance B precursor  34.98 
 
 
326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2339  copper resistance B precursor  33.21 
 
 
343 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254235  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5182  copper resistance B precursor  31.22 
 
 
371 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.336515  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5670  copper resistance protein B  32.89 
 
 
360 aa  129  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.366564  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0449  copper resistance B precursor  34.35 
 
 
326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.835872  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5379  copper resistance B precursor  30.77 
 
 
369 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.486591 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3232  copper resistance protein B  30.93 
 
 
397 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.197761  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2217  copper resistance B precursor  31.22 
 
 
363 aa  124  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0429936  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1494  copper resistance B precursor  32.42 
 
 
312 aa  116  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.196943  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2457  copper resistance B precursor  32.33 
 
 
323 aa  114  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379097  normal  0.733317 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0573  copper resistance B precursor  31.74 
 
 
311 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.972949 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37810  copper resistance protein B precursor  31.02 
 
 
351 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0815776  normal  0.208347 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3811  copper resistance B precursor  31.54 
 
 
301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.992888  normal  0.848683 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2488  copper resistance B precursor  30.18 
 
 
337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519855  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1267  copper resistance B precursor  31.71 
 
 
303 aa  107  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00955945  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1970  copper resistance B precursor  31.79 
 
 
237 aa  106  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1574  copper resistance B precursor  31.07 
 
 
235 aa  105  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4288  copper resistance B precursor  31.79 
 
 
237 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.28688  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0250  copper resistance B precursor  31.79 
 
 
237 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2351  copper resistance B precursor  28 
 
 
398 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2115  copper resistance B precursor  31.25 
 
 
235 aa  104  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2930  copper resistance B precursor  29.73 
 
 
347 aa  104  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3545  copper resistance B precursor  30.05 
 
 
237 aa  103  7e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0320075  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0347  copper resistance B precursor  32.98 
 
 
236 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.515255 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0093  copper resistance B precursor  30.38 
 
 
314 aa  102  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1712  copper resistance B precursor  29.48 
 
 
288 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.322874  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0381  copper resistance B precursor  29.03 
 
 
353 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1827  copper resistance B precursor  32.12 
 
 
291 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.193991  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2220  copper resistance B precursor  31.84 
 
 
341 aa  98.2  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.205984  normal  0.780487 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0785  copper resistance B precursor  29.47 
 
 
321 aa  97.1  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.969863  normal  0.401852 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03131  copper resistance protein B  27.07 
 
 
368 aa  95.9  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1708  copper resistance B precursor  27.91 
 
 
237 aa  91.7  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00160337  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1376  copper resistance B precursor  30.35 
 
 
247 aa  90.9  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.379919  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2135  copper resistance B precursor  25.78 
 
 
351 aa  90.1  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4396  copper resistance B precursor  28.88 
 
 
256 aa  90.1  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.523353  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2204  copper resistance protein B, putative  32.7 
 
 
294 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0202  copper resistance B precursor  27.57 
 
 
260 aa  89  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0127  copper resistance B precursor  29.32 
 
 
246 aa  88.2  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00270  Copper resistance B precursor  26.53 
 
 
323 aa  87.4  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0273  copper resistance B precursor  27.96 
 
 
274 aa  87.4  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.500422  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1482  copper resistance B precursor  27.89 
 
 
272 aa  86.7  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000648661 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2491  copper resistance B precursor  27.31 
 
 
305 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2205  copper resistance B precursor  28.5 
 
 
262 aa  85.1  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3915  copper resistance protein B  28.1 
 
 
258 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5375  copper resistance B precursor  27.98 
 
 
306 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.357667 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3622  copper resistance B precursor  27.31 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1570  copper resistance B precursor  27.82 
 
 
302 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.729928  normal  0.0120943 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2421  copper resistance B precursor  25.36 
 
 
403 aa  82.8  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3415  copper resistance B precursor  24.91 
 
 
298 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0382  copper-resistance protein, CopA family  48.91 
 
 
638 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1969  copper-resistance protein, CopA family protein  64.1 
 
 
657 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1590  copper-resistance protein CopB  95 
 
 
339 aa  77.8  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000266353  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0249  CopA family copper resistance protein  56.25 
 
 
672 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  26.42 
 
 
263 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00404  hypothetical protein  28.91 
 
 
235 aa  75.1  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0109  copper resistance protein B precursor  31.02 
 
 
289 aa  74.3  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3546  copper-resistance protein CopA  42.15 
 
 
664 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0666183  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02790  hypothetical protein  32.73 
 
 
349 aa  71.2  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.874218  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1404  hypothetical protein  24.07 
 
 
436 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000355362  hitchhiker  0.00105308 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4266  copper resistance B precursor  29.1 
 
 
249 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.852956  decreased coverage  0.00992965 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2630  copper resistance B precursor  25.73 
 
 
313 aa  68.9  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.879879  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0189  putative copper resistance protein CopB precursor  25.27 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0015  CopA family copper resistance protein  54.13 
 
 
671 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.156592  normal  0.0651456 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0017  CopA family copper resistance protein  54.13 
 
 
652 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0816359  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0015  CopA family copper resistance protein  54.13 
 
 
652 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275431  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.9 
 
 
14916 aa  61.2  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2345  hypothetical protein  25.68 
 
 
1064 aa  60.1  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6893  multicopper oxidase type 3  35.71 
 
 
941 aa  60.1  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.845063 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  24.06 
 
 
1191 aa  59.7  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6647  multicopper oxidase type 3  34.69 
 
 
946 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0481943  normal  0.204114 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  28.48 
 
 
1033 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0713  hypothetical protein  59.32 
 
 
190 aa  57.4  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  37.8 
 
 
277 aa  57  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4287  CopA family copper resistance protein  53.62 
 
 
642 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.221422  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0800  copper resistance protein B  25.27 
 
 
803 aa  56.2  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  23.15 
 
 
600 aa  55.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  25.45 
 
 
449 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4077  hypothetical protein  36.89 
 
 
374 aa  53.9  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.313284  hitchhiker  0.00876664 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  24.84 
 
 
320 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  24.58 
 
 
493 aa  53.5  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  30.3 
 
 
343 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  30.3 
 
 
343 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  22.6 
 
 
182 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  29.59 
 
 
250 aa  52  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>