23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_34245 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_34245  predicted protein  100 
 
 
164 aa  294  4e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0191281  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_40475  predicted protein  42 
 
 
130 aa  72.4  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.802438  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40672  predicted protein  47.47 
 
 
1034 aa  68.2  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50095  predicted protein  45.59 
 
 
982 aa  67.4  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38100  predicted protein  38.55 
 
 
133 aa  60.8  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13439  predicted protein  40.38 
 
 
347 aa  60.1  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199719  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44134  predicted protein  42.34 
 
 
245 aa  59.3  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1839  copper resistance B precursor  31.68 
 
 
429 aa  57.4  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.425584  hitchhiker  0.0000315743 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11472  predicted protein  39.71 
 
 
344 aa  56.2  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.408612  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2382  TRD5  43.01 
 
 
253 aa  55.5  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0954  hypothetical protein  32.79 
 
 
82 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.167212  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48553  predicted protein  41.51 
 
 
952 aa  52  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.102709  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5101  copper resistance B precursor  25.9 
 
 
421 aa  50.8  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.082477 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15060  predicted protein  42.11 
 
 
191 aa  49.3  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4928  hypothetical protein  38.71 
 
 
315 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.443955 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0361  hypothetical protein  39.29 
 
 
294 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.926631  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3267  hypothetical protein  36.49 
 
 
537 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0354  hypothetical protein  39.29 
 
 
294 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1045  putative transposase  45.1 
 
 
343 aa  43.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0831423  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0252  flagellar assembly protein H  37.33 
 
 
236 aa  42.4  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3380  flagellar assembly protein H  37.33 
 
 
236 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.972464  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  31.96 
 
 
3670 aa  41.6  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0903  Chromosome segregation ATPase-like protein  37.93 
 
 
1022 aa  40.8  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>