71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0127 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0127  copper resistance B precursor  100 
 
 
246 aa  494  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0202  copper resistance B precursor  40.58 
 
 
260 aa  154  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0189  putative copper resistance protein CopB precursor  37.38 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0381  copper resistance B precursor  38.14 
 
 
353 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1970  copper resistance B precursor  35.34 
 
 
237 aa  126  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0250  copper resistance B precursor  39.01 
 
 
237 aa  125  6e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4288  copper resistance B precursor  39.01 
 
 
237 aa  125  6e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.28688  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1325  copper resistance protein B  42.26 
 
 
288 aa  123  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.282385  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1574  copper resistance B precursor  39.23 
 
 
235 aa  123  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3545  copper resistance B precursor  33.05 
 
 
237 aa  122  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0320075  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2351  copper resistance B precursor  37.77 
 
 
398 aa  122  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2421  copper resistance B precursor  36.71 
 
 
403 aa  121  9e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2115  copper resistance B precursor  40.74 
 
 
235 aa  121  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5379  copper resistance B precursor  36.59 
 
 
369 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.486591 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0013  copper resistance B precursor  38.35 
 
 
371 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.188743  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0015  copper resistance B precursor  38.35 
 
 
371 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0966383  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0013  copper resistance B precursor  38.35 
 
 
371 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.001908  normal  0.0882664 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2217  copper resistance B precursor  37.38 
 
 
363 aa  119  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0429936  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5182  copper resistance B precursor  37.38 
 
 
371 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.336515  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0449  copper resistance B precursor  34.78 
 
 
326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.835872  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3106  copper resistance B precursor  40.74 
 
 
341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37471  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5670  copper resistance protein B  38.86 
 
 
360 aa  115  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.366564  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2930  copper resistance B precursor  36.76 
 
 
347 aa  115  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0657  copper resistance protein B  36.06 
 
 
346 aa  115  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1720  copper resistance B precursor  37.87 
 
 
324 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.099384  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5337  copper resistance B precursor  37.87 
 
 
324 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931181  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6113  Cu(II)/Cu(I) resistance outer membrane protein CopB  35.79 
 
 
495 aa  115  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.109399  normal  0.679723 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1234  copper resistance B precursor  34.3 
 
 
326 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0573  copper resistance B precursor  35.92 
 
 
311 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.972949 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2220  copper resistance B precursor  33.48 
 
 
341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.205984  normal  0.780487 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0785  copper resistance B precursor  32.6 
 
 
321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.969863  normal  0.401852 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1712  copper resistance B precursor  35.92 
 
 
288 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.322874  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3256  copper resistance B precursor  34.29 
 
 
318 aa  112  6e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.27948  normal  0.22863 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5101  copper resistance B precursor  36.36 
 
 
421 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.082477 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1946  putative copper resistance protein B  34.29 
 
 
287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.300672  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1778  copper resistance B precursor  36.69 
 
 
332 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104151  normal  0.145157 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2491  copper resistance B precursor  34.88 
 
 
305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3622  copper resistance B precursor  34.88 
 
 
305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1839  copper resistance B precursor  35.83 
 
 
429 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.425584  hitchhiker  0.0000315743 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1494  copper resistance B precursor  34.63 
 
 
312 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.196943  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2488  copper resistance B precursor  39.86 
 
 
337 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519855  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2339  copper resistance B precursor  32.84 
 
 
343 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254235  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3811  copper resistance B precursor  34.8 
 
 
301 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.992888  normal  0.848683 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5375  copper resistance B precursor  40.97 
 
 
306 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.357667 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2205  copper resistance B precursor  34.15 
 
 
262 aa  107  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3232  copper resistance protein B  35.12 
 
 
397 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.197761  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37810  copper resistance protein B precursor  34.63 
 
 
351 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0815776  normal  0.208347 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03131  copper resistance protein B  36.87 
 
 
368 aa  106  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2135  copper resistance B precursor  35.11 
 
 
351 aa  106  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3415  copper resistance B precursor  34.78 
 
 
298 aa  104  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1376  copper resistance B precursor  34.55 
 
 
247 aa  103  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.379919  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1482  copper resistance B precursor  35.61 
 
 
272 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000648661 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4396  copper resistance B precursor  33.96 
 
 
256 aa  100  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.523353  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1570  copper resistance B precursor  33.82 
 
 
302 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.729928  normal  0.0120943 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00270  Copper resistance B precursor  34.63 
 
 
323 aa  99.8  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2630  copper resistance B precursor  33.48 
 
 
313 aa  99.4  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.879879  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1708  copper resistance B precursor  30.84 
 
 
237 aa  99  7e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00160337  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00404  hypothetical protein  31.28 
 
 
235 aa  99  7e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0347  copper resistance B precursor  34.98 
 
 
236 aa  97.4  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.515255 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1827  copper resistance B precursor  32.86 
 
 
291 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.193991  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1267  copper resistance B precursor  33.33 
 
 
303 aa  96.7  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00955945  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0711  copper resistance B precursor  30.37 
 
 
354 aa  96.3  4e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.136599 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4266  copper resistance B precursor  35.39 
 
 
249 aa  95.9  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.852956  decreased coverage  0.00992965 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2204  copper resistance protein B, putative  31.9 
 
 
294 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3915  copper resistance protein B  34.31 
 
 
258 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0273  copper resistance B precursor  36.73 
 
 
274 aa  93.6  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.500422  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0696  putative copper-resistance protein CopB  29.32 
 
 
384 aa  88.6  8e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000706782  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1590  copper-resistance protein CopB  29.03 
 
 
339 aa  87  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000266353  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2457  copper resistance B precursor  29.27 
 
 
323 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379097  normal  0.733317 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0109  copper resistance protein B precursor  30.81 
 
 
289 aa  75.5  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0093  copper resistance B precursor  30.33 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>