86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1590 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1590  copper-resistance protein CopB  100 
 
 		 339 aa  686    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000266353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0696  putative copper-resistance protein CopB  79.43 
 
 		 384 aa  597  1e-169  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000706782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0711  copper resistance B precursor  74.66 
 
 		 354 aa  527  1e-149  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136599 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1839  copper resistance B precursor  34.89 
 
 		 429 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.425584  hitchhiker  0.0000315743 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6113  Cu(II)/Cu(I) resistance outer membrane protein CopB  34.36 
 
 		 495 aa  144  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.109399  normal  0.679723 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5101  copper resistance B precursor  33.96 
 
 		 421 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.082477 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0657  copper resistance protein B  32.63 
 
 		 346 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1325  copper resistance protein B  35.92 
 
 		 288 aa  135  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.282385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1778  copper resistance B precursor  35.5 
 
 		 332 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104151  normal  0.145157 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3256  copper resistance B precursor  33.94 
 
 		 318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.27948  normal  0.22863 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1946  putative copper resistance protein B  31.84 
 
 		 287 aa  130  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.300672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3106  copper resistance B precursor  31.5 
 
 		 341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37471  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5379  copper resistance B precursor  31.92 
 
 		 369 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.486591 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0013  copper resistance B precursor  32.23 
 
 		 371 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.001908  normal  0.0882664 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0015  copper resistance B precursor  32.23 
 
 		 371 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0966383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0013  copper resistance B precursor  32.23 
 
 		 371 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.188743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1720  copper resistance B precursor  34.27 
 
 		 324 aa  125  9e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.099384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1234  copper resistance B precursor  34.78 
 
 		 326 aa  123  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2339  copper resistance B precursor  33.21 
 
 		 343 aa  122  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5337  copper resistance B precursor  31.29 
 
 		 324 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2457  copper resistance B precursor  31.62 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379097  normal  0.733317 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0449  copper resistance B precursor  34.13 
 
 		 326 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.835872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5670  copper resistance protein B  32 
 
 		 360 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.366564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2217  copper resistance B precursor  30.32 
 
 		 363 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0429936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5182  copper resistance B precursor  30.37 
 
 		 371 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.336515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1494  copper resistance B precursor  30.25 
 
 		 312 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.196943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3232  copper resistance protein B  30.61 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.197761  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0573  copper resistance B precursor  32.52 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.972949 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37810  copper resistance protein B precursor  30.77 
 
 		 351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0815776  normal  0.208347 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3811  copper resistance B precursor  30.29 
 
 		 301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.992888  normal  0.848683 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1267  copper resistance B precursor  32.39 
 
 		 303 aa  110  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00955945  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2488  copper resistance B precursor  26.89 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519855  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1970  copper resistance B precursor  32.82 
 
 		 237 aa  105  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4288  copper resistance B precursor  32.31 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.28688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0250  copper resistance B precursor  32.31 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3545  copper resistance B precursor  29.53 
 
 		 237 aa  102  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0320075  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2930  copper resistance B precursor  28 
 
 		 347 aa  101  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2220  copper resistance B precursor  32.18 
 
 		 341 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.205984  normal  0.780487 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1712  copper resistance B precursor  29.64 
 
 		 288 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.322874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0347  copper resistance B precursor  31.91 
 
 		 236 aa  100  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515255 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1574  copper resistance B precursor  30.81 
 
 		 235 aa  99.8  7e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0093  copper resistance B precursor  28.48 
 
 		 314 aa  99.8  7e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0785  copper resistance B precursor  30.21 
 
 		 321 aa  99.4  8e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.969863  normal  0.401852 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2351  copper resistance B precursor  27.48 
 
 		 398 aa  99.4  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2115  copper resistance B precursor  30.73 
 
 		 235 aa  99  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2135  copper resistance B precursor  26.32 
 
 		 351 aa  99  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4396  copper resistance B precursor  29.95 
 
 		 256 aa  97.8  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.523353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1708  copper resistance B precursor  30.99 
 
 		 237 aa  97.1  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00160337  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0381  copper resistance B precursor  30.05 
 
 		 353 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1827  copper resistance B precursor  31.09 
 
 		 291 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.193991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03131  copper resistance protein B  28.05 
 
 		 368 aa  94  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0202  copper resistance B precursor  29.77 
 
 		 260 aa  92.4  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2204  copper resistance protein B, putative  32.21 
 
 		 294 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0273  copper resistance B precursor  28.44 
 
 		 274 aa  90.5  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.500422  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2491  copper resistance B precursor  27.31 
 
 		 305 aa  89.4  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3622  copper resistance B precursor  27.31 
 
 		 305 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00270  Copper resistance B precursor  26.64 
 
 		 323 aa  88.2  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1376  copper resistance B precursor  28.86 
 
 		 247 aa  86.7  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.379919  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1482  copper resistance B precursor  28.42 
 
 		 272 aa  86.3  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000648661 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0127  copper resistance B precursor  29.41 
 
 		 246 aa  85.9  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1570  copper resistance B precursor  30.39 
 
 		 302 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.729928  normal  0.0120943 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2205  copper resistance B precursor  29.5 
 
 		 262 aa  85.5  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3415  copper resistance B precursor  25.34 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5375  copper resistance B precursor  28.42 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.357667 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2421  copper resistance B precursor  26.45 
 
 		 403 aa  82.8  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0109  copper resistance protein B precursor  32.09 
 
 		 289 aa  81.6  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3915  copper resistance protein B  27.01 
 
 		 258 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00404  hypothetical protein  29.72 
 
 		 235 aa  78.2  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4266  copper resistance B precursor  30.53 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.852956  decreased coverage  0.00992965 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0189  putative copper resistance protein CopB precursor  27.07 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1969  copper-resistance protein, CopA family protein  58.9 
 
 		 657 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3546  copper-resistance protein CopA  55.88 
 
 		 664 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0666183  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2630  copper resistance B precursor  25.52 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.879879  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2345  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1064 aa  61.2  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0800  copper resistance protein B  25.82 
 
 		 803 aa  60.1  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0249  CopA family copper resistance protein  58.73 
 
 		 672 aa  59.3  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0713  hypothetical protein  53.23 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4287  CopA family copper resistance protein  51.52 
 
 		 642 aa  52.8  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.221422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0382  copper-resistance protein, CopA family  40.98 
 
 		 638 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1947  putative copper resistance transmembrane protein  47.06 
 
 		 627 aa  45.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.809096 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  23.08 
 
 		 263 aa  44.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6893  multicopper oxidase type 3  38 
 
 		 941 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.845063 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06367  hypothetical protein  44.59 
 
 		 188 aa  44.3  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0126  CopA family copper resistance protein  34.92 
 
 		 569 aa  43.1  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6647  multicopper oxidase type 3  31.85 
 
 		 946 aa  42.7  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0481943  normal  0.204114 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.67 
 
 		 14916 aa  42.7  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>