92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2217 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2217  copper resistance B precursor  100 
 
 		 363 aa  747    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0429936  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5379  copper resistance B precursor  77.26 
 
 		 369 aa  567  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.486591 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0013  copper resistance B precursor  75.53 
 
 		 371 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.188743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0015  copper resistance B precursor  75.53 
 
 		 371 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0966383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0013  copper resistance B precursor  75.53 
 
 		 371 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.001908  normal  0.0882664 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5182  copper resistance B precursor  77.51 
 
 		 371 aa  564  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.336515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0573  copper resistance B precursor  70.25 
 
 		 311 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.972949 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3232  copper resistance protein B  65.69 
 
 		 397 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.197761  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1712  copper resistance B precursor  80.66 
 
 		 288 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.322874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37810  copper resistance protein B precursor  68.56 
 
 		 351 aa  455  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0815776  normal  0.208347 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3811  copper resistance B precursor  65.44 
 
 		 301 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.992888  normal  0.848683 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1494  copper resistance B precursor  63.41 
 
 		 312 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.196943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1570  copper resistance B precursor  65.41 
 
 		 302 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.729928  normal  0.0120943 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3915  copper resistance protein B  63.95 
 
 		 258 aa  352  8e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00270  Copper resistance B precursor  56.83 
 
 		 323 aa  350  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3106  copper resistance B precursor  52.81 
 
 		 341 aa  327  2.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3415  copper resistance B precursor  58.33 
 
 		 298 aa  322  7e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1827  copper resistance B precursor  56.67 
 
 		 291 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.193991  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2204  copper resistance protein B, putative  54.15 
 
 		 294 aa  316  3e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03131  copper resistance protein B  45.11 
 
 		 368 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6113  Cu(II)/Cu(I) resistance outer membrane protein CopB  48.41 
 
 		 495 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.109399  normal  0.679723 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1839  copper resistance B precursor  40.38 
 
 		 429 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.425584  hitchhiker  0.0000315743 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5101  copper resistance B precursor  42.09 
 
 		 421 aa  243  5e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.082477 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2421  copper resistance B precursor  38.69 
 
 		 403 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1325  copper resistance protein B  53.2 
 
 		 288 aa  226  6e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.282385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2339  copper resistance B precursor  45.49 
 
 		 343 aa  220  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254235  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0657  copper resistance protein B  42.31 
 
 		 346 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1970  copper resistance B precursor  46.92 
 
 		 237 aa  219  5e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2488  copper resistance B precursor  53.2 
 
 		 337 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519855  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3545  copper resistance B precursor  47.62 
 
 		 237 aa  218  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0320075  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0250  copper resistance B precursor  46.92 
 
 		 237 aa  218  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4288  copper resistance B precursor  46.92 
 
 		 237 aa  218  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.28688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1778  copper resistance B precursor  41.89 
 
 		 332 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104151  normal  0.145157 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5375  copper resistance B precursor  42.12 
 
 		 306 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.357667 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5670  copper resistance protein B  49.29 
 
 		 360 aa  215  9e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.366564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0202  copper resistance B precursor  50.96 
 
 		 260 aa  214  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2351  copper resistance B precursor  48.37 
 
 		 398 aa  212  7e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1234  copper resistance B precursor  39.61 
 
 		 326 aa  212  7.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0449  copper resistance B precursor  39.33 
 
 		 326 aa  210  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.835872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5337  copper resistance B precursor  40.54 
 
 		 324 aa  209  5e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1482  copper resistance B precursor  47 
 
 		 272 aa  209  5e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000648661 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1720  copper resistance B precursor  40.54 
 
 		 324 aa  209  6e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.099384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0273  copper resistance B precursor  39.38 
 
 		 274 aa  203  3e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.500422  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0347  copper resistance B precursor  46.7 
 
 		 236 aa  199  6e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515255 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2930  copper resistance B precursor  37.4 
 
 		 347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2135  copper resistance B precursor  37.27 
 
 		 351 aa  194  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0785  copper resistance B precursor  46.34 
 
 		 321 aa  194  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.969863  normal  0.401852 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4396  copper resistance B precursor  44.25 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.523353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2115  copper resistance B precursor  46.77 
 
 		 235 aa  191  2e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0381  copper resistance B precursor  44.55 
 
 		 353 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1574  copper resistance B precursor  46.27 
 
 		 235 aa  190  4e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1946  putative copper resistance protein B  44.28 
 
 		 287 aa  185  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.300672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2220  copper resistance B precursor  43.4 
 
 		 341 aa  184  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.205984  normal  0.780487 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3256  copper resistance B precursor  38.32 
 
 		 318 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.27948  normal  0.22863 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2205  copper resistance B precursor  44.09 
 
 		 262 aa  183  5.0000000000000004e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0093  copper resistance B precursor  37.93 
 
 		 314 aa  180  4e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4266  copper resistance B precursor  43.81 
 
 		 249 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.852956  decreased coverage  0.00992965 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3622  copper resistance B precursor  41.94 
 
 		 305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2491  copper resistance B precursor  41.94 
 
 		 305 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1376  copper resistance B precursor  43.18 
 
 		 247 aa  172  9e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.379919  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2630  copper resistance B precursor  35.48 
 
 		 313 aa  172  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.879879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1267  copper resistance B precursor  39.37 
 
 		 303 aa  166  8e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00955945  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0109  copper resistance protein B precursor  41.31 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2457  copper resistance B precursor  34.21 
 
 		 323 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379097  normal  0.733317 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0189  putative copper resistance protein CopB precursor  38.89 
 
 		 260 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1708  copper resistance B precursor  37.25 
 
 		 237 aa  144  3e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00160337  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0711  copper resistance B precursor  31.52 
 
 		 354 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136599 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00404  hypothetical protein  38.43 
 
 		 235 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0696  putative copper-resistance protein CopB  30.56 
 
 		 384 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000706782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0127  copper resistance B precursor  37.38 
 
 		 246 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1590  copper-resistance protein CopB  31.86 
 
 		 339 aa  99.8  7e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000266353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3546  copper-resistance protein CopA  47.9 
 
 		 664 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0666183  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0015  CopA family copper resistance protein  52.43 
 
 		 652 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0017  CopA family copper resistance protein  52.43 
 
 		 652 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0816359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0015  CopA family copper resistance protein  52.43 
 
 		 671 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.156592  normal  0.0651456 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5380  copper resistance protein A  46.4 
 
 		 669 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.537951 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0800  copper resistance protein B  21.95 
 
 		 803 aa  58.2  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1969  copper-resistance protein, CopA family protein  49.38 
 
 		 657 aa  56.2  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0382  copper-resistance protein, CopA family  46.07 
 
 		 638 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0249  CopA family copper resistance protein  45.83 
 
 		 672 aa  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6893  multicopper oxidase type 3  38.21 
 
 		 941 aa  50.4  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.845063 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0574  CopA family copper resistance protein  38.4 
 
 		 619 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1371  hypothetical protein  36.67 
 
 		 242 aa  48.5  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2931  hypothetical protein  22.33 
 
 		 232 aa  47.8  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.771222  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2345  hypothetical protein  19.78 
 
 		 1064 aa  46.6  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2219  CopA family copper resistance protein  50.77 
 
 		 604 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00411811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5180  CopA family copper resistance protein  37.89 
 
 		 605 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4287  CopA family copper resistance protein  51.61 
 
 		 642 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.221422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1947  putative copper resistance transmembrane protein  39.22 
 
 		 627 aa  45.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.809096 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6647  multicopper oxidase type 3  40 
 
 		 946 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0481943  normal  0.204114 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3914  copper resistance protein A  36.79 
 
 		 589 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001394  hypothetical protein  42.03 
 
 		 188 aa  43.1  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000508588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>