27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1172 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1172  ATPase  100 
 
 		 374 aa  751    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0968898 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0542  ATPase  61.46 
 
 		 377 aa  481  1e-135  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2867  ATPase  38.64 
 
 		 386 aa  271  1e-71  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0177  ATPase  33.84 
 
 		 368 aa  175  9.999999999999999e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.335522 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2817  ATPase  27.37 
 
 		 360 aa  124  3e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0433  ATPase  29.92 
 
 		 359 aa  93.2  7e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.520428  hitchhiker  0.00910824 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0150  ATPase  28.53 
 
 		 360 aa  89  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1746  hypothetical protein  25.79 
 
 		 373 aa  85.5  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000207576  normal  0.634791 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2746  ATPase  22.28 
 
 		 387 aa  84  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0705142  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1584  ATPase  29.41 
 
 		 356 aa  83.2  0.000000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0503  ATPase  24.66 
 
 		 377 aa  79.7  0.00000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.241974 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1486  ATPase  25.41 
 
 		 350 aa  79.3  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.659076  normal  0.220459 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  23.83 
 
 		 1868 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1267  ATPase  27.15 
 
 		 342 aa  72.4  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1319  ATPase  36.43 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1933  ATPase  24.93 
 
 		 356 aa  72.4  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0359991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1739  ATPase  25.2 
 
 		 383 aa  72.4  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1794  ATPase  25.2 
 
 		 365 aa  71.2  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0171546  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0384  ATPase  24.08 
 
 		 361 aa  68.9  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.000000176931  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2379  ATPase  24.14 
 
 		 356 aa  67  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0111  hypothetical protein  22.94 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.0000000108585  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4454  hypothetical protein  23.81 
 
 		 917 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2078  hypothetical protein  28.57 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0718  hypothetical protein  23.4 
 
 		 397 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000890529 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2362  ATPase  35 
 
 		 464 aa  45.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2821  ATPase  23.16 
 
 		 474 aa  44.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000929757  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0736  ATPase  31.9 
 
 		 443 aa  43.9  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.299447  normal  0.251724 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>